Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BccipQ9CWI3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BccipQ9CWI3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BccipQ9CWI3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BccipQ9CWI3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BccipQ9CWI3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BccipQ9CWI3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BccipQ9CWI3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BccipQ9CWI3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BccipQ9CWI3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BccipQ9CWI3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BccipQ9CWI3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BccipQ9CWI3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BccipQ9CWI3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BccipQ9CWI3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BccipQ9CWI3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BccipQ9CWI3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BccipQ9CWI3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BccipQ9CWI3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BccipQ9CWI3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BccipQ9CWI3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BccipQ9CWI3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BccipQ9CWI3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BccipQ9CWI3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BccipQ9CWI3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BccipQ9CWI3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BccipQ9CWI3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BccipQ9CWI3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BccipQ9CWI3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BccipQ9CWI3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BccipQ9CWI3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BccipQ9CWI3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BccipQ9CWI3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BccipQ9CWI3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BccipQ9CWI3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BccipQ9CWI3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BccipQ9CWI3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BccipQ9CWI3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BccipQ9CWI3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BccipQ9CWI3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BccipQ9CWI3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BccipQ9CWI3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BccipQ9CWI3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BccipQ9CWI3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BccipQ9CWI3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BccipQ9CWI3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BccipQ9CWI3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BccipQ9CWI3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BccipQ9CWI3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BccipQ9CWI3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BccipQ9CWI3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BccipQ9CWI3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BccipQ9CWI3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BccipQ9CWI3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BccipQ9CWI3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BccipQ9CWI3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BccipQ9CWI3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BccipQ9CWI3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BccipQ9CWI3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BccipQ9CWI3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BccipQ9CWI3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BccipQ9CWI3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BccipQ9CWI3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BccipQ9CWI3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BccipQ9CWI3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BccipQ9CWI3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BccipQ9CWI3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BccipQ9CWI3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BccipQ9CWI3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BccipQ9CWI3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BccipQ9CWI3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BccipQ9CWI3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BccipQ9CWI3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BccipQ9CWI3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BccipQ9CWI3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BccipQ9CWI3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BccipQ9CWI3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BccipQ9CWI3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BccipQ9CWI3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BccipQ9CWI3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BccipQ9CWI3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BccipQ9CWI3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
BccipQ9CWI3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BccipQ9CWI3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BccipQ9CWI3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BccipQ9CWI3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BccipQ9CWI3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BccipQ9CWI3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BccipQ9CWI3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BccipQ9CWI3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BccipQ9CWI3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BccipQ9CWI3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BccipQ9CWI3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BccipQ9CWI3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BccipQ9CWI3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BccipQ9CWI3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BccipQ9CWI3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BccipQ9CWI3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BccipQ9CWI3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BccipQ9CWI3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms