Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR99

4930544G11Rik, RIKEN cDNA 4930544G11, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544G11RikQ9CR99 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930544G11RikQ9CR99 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930544G11RikQ9CR99 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms