Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc43Q9CR29 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc43Q9CR29 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc43Q9CR29 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc43Q9CR29 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc43Q9CR29 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc43Q9CR29 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc43Q9CR29 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc43Q9CR29 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc43Q9CR29 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc43Q9CR29 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc43Q9CR29 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc43Q9CR29 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc43Q9CR29 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc43Q9CR29 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc43Q9CR29 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc43Q9CR29 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc43Q9CR29 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc43Q9CR29 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc43Q9CR29 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc43Q9CR29 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc43Q9CR29 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc43Q9CR29 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc43Q9CR29 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc43Q9CR29 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc43Q9CR29 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc43Q9CR29 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc43Q9CR29 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc43Q9CR29 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc43Q9CR29 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc43Q9CR29 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc43Q9CR29 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc43Q9CR29 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc43Q9CR29 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc43Q9CR29 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc43Q9CR29 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc43Q9CR29 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc43Q9CR29 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc43Q9CR29 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc43Q9CR29 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc43Q9CR29 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc43Q9CR29 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc43Q9CR29 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc43Q9CR29 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc43Q9CR29 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc43Q9CR29 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc43Q9CR29 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc43Q9CR29 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc43Q9CR29 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc43Q9CR29 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc43Q9CR29 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc43Q9CR29 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc43Q9CR29 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc43Q9CR29 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc43Q9CR29 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc43Q9CR29 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc43Q9CR29 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc43Q9CR29 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc43Q9CR29 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc43Q9CR29 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc43Q9CR29 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc43Q9CR29 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc43Q9CR29 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc43Q9CR29 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc43Q9CR29 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc43Q9CR29 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc43Q9CR29 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc43Q9CR29 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc43Q9CR29 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc43Q9CR29 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc43Q9CR29 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc43Q9CR29 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc43Q9CR29 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc43Q9CR29 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc43Q9CR29 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc43Q9CR29 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms