Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD4

Chmp1b2, Charged multivesicular body protein 1b-2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b2Q9CQD4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp1b2Q9CQD4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp1b2Q9CQD4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp1b2Q9CQD4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp1b2Q9CQD4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp1b2Q9CQD4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp1b2Q9CQD4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp1b2Q9CQD4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp1b2Q9CQD4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp1b2Q9CQD4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chmp1b2Q9CQD4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chmp1b2Q9CQD4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chmp1b2Q9CQD4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chmp1b2Q9CQD4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp1b2Q9CQD4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp1b2Q9CQD4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp1b2Q9CQD4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp1b2Q9CQD4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chmp1b2Q9CQD4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp1b2Q9CQD4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp1b2Q9CQD4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp1b2Q9CQD4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp1b2Q9CQD4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp1b2Q9CQD4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp1b2Q9CQD4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp1b2Q9CQD4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp1b2Q9CQD4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp1b2Q9CQD4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp1b2Q9CQD4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp1b2Q9CQD4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp1b2Q9CQD4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp1b2Q9CQD4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chmp1b2Q9CQD4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp1b2Q9CQD4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp1b2Q9CQD4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp1b2Q9CQD4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp1b2Q9CQD4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp1b2Q9CQD4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp1b2Q9CQD4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp1b2Q9CQD4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp1b2Q9CQD4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp1b2Q9CQD4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp1b2Q9CQD4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp1b2Q9CQD4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp1b2Q9CQD4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp1b2Q9CQD4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp1b2Q9CQD4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp1b2Q9CQD4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp1b2Q9CQD4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp1b2Q9CQD4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms