Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ79

Txndc9, Thioredoxin domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc9Q9CQ79 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Txndc9Q9CQ79 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Txndc9Q9CQ79 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Txndc9Q9CQ79 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Txndc9Q9CQ79 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Txndc9Q9CQ79 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Txndc9Q9CQ79 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Txndc9Q9CQ79 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Txndc9Q9CQ79 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Txndc9Q9CQ79 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Txndc9Q9CQ79 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Txndc9Q9CQ79 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Txndc9Q9CQ79 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Txndc9Q9CQ79 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Txndc9Q9CQ79 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Txndc9Q9CQ79 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Txndc9Q9CQ79 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Txndc9Q9CQ79 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Txndc9Q9CQ79 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Txndc9Q9CQ79 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Txndc9Q9CQ79 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Txndc9Q9CQ79 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Txndc9Q9CQ79 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Txndc9Q9CQ79 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Txndc9Q9CQ79 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Txndc9Q9CQ79 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Txndc9Q9CQ79 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Txndc9Q9CQ79 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Txndc9Q9CQ79 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Txndc9Q9CQ79 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Txndc9Q9CQ79 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Txndc9Q9CQ79 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Txndc9Q9CQ79 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Txndc9Q9CQ79 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Txndc9Q9CQ79 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Txndc9Q9CQ79 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Txndc9Q9CQ79 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Txndc9Q9CQ79 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Txndc9Q9CQ79 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Txndc9Q9CQ79 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Txndc9Q9CQ79 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Txndc9Q9CQ79 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Txndc9Q9CQ79 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Txndc9Q9CQ79 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Txndc9Q9CQ79 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Txndc9Q9CQ79 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Txndc9Q9CQ79 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Txndc9Q9CQ79 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Txndc9Q9CQ79 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Txndc9Q9CQ79 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Txndc9Q9CQ79 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Txndc9Q9CQ79 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Txndc9Q9CQ79 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Txndc9Q9CQ79 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Txndc9Q9CQ79 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Txndc9Q9CQ79 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Txndc9Q9CQ79 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms