Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930550L24RikQ99PA7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930550L24RikQ99PA7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930550L24RikQ99PA7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930550L24RikQ99PA7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930550L24RikQ99PA7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930550L24RikQ99PA7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930550L24RikQ99PA7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930550L24RikQ99PA7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930550L24RikQ99PA7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930550L24RikQ99PA7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930550L24RikQ99PA7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930550L24RikQ99PA7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930550L24RikQ99PA7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930550L24RikQ99PA7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930550L24RikQ99PA7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930550L24RikQ99PA7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930550L24RikQ99PA7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930550L24RikQ99PA7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930550L24RikQ99PA7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930550L24RikQ99PA7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930550L24RikQ99PA7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930550L24RikQ99PA7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930550L24RikQ99PA7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
4930550L24RikQ99PA7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930550L24RikQ99PA7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930550L24RikQ99PA7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930550L24RikQ99PA7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930550L24RikQ99PA7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930550L24RikQ99PA7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
4930550L24RikQ99PA7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930550L24RikQ99PA7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930550L24RikQ99PA7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930550L24RikQ99PA7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930550L24RikQ99PA7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930550L24RikQ99PA7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930550L24RikQ99PA7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930550L24RikQ99PA7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930550L24RikQ99PA7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930550L24RikQ99PA7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930550L24RikQ99PA7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930550L24RikQ99PA7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930550L24RikQ99PA7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930550L24RikQ99PA7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930550L24RikQ99PA7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930550L24RikQ99PA7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930550L24RikQ99PA7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930550L24RikQ99PA7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
4930550L24RikQ99PA7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930550L24RikQ99PA7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930550L24RikQ99PA7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930550L24RikQ99PA7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930550L24RikQ99PA7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930550L24RikQ99PA7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930550L24RikQ99PA7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930550L24RikQ99PA7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930550L24RikQ99PA7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930550L24RikQ99PA7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930550L24RikQ99PA7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930550L24RikQ99PA7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930550L24RikQ99PA7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930550L24RikQ99PA7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930550L24RikQ99PA7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930550L24RikQ99PA7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930550L24RikQ99PA7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930550L24RikQ99PA7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930550L24RikQ99PA7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930550L24RikQ99PA7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930550L24RikQ99PA7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930550L24RikQ99PA7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930550L24RikQ99PA7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930550L24RikQ99PA7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4930550L24RikQ99PA7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4930550L24RikQ99PA7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
4930550L24RikQ99PA7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
4930550L24RikQ99PA7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930550L24RikQ99PA7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
4930550L24RikQ99PA7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930550L24RikQ99PA7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
4930550L24RikQ99PA7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930550L24RikQ99PA7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930550L24RikQ99PA7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930550L24RikQ99PA7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930550L24RikQ99PA7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930550L24RikQ99PA7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930550L24RikQ99PA7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930550L24RikQ99PA7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
4930550L24RikQ99PA7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930550L24RikQ99PA7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930550L24RikQ99PA7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930550L24RikQ99PA7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930550L24RikQ99PA7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930550L24RikQ99PA7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930550L24RikQ99PA7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930550L24RikQ99PA7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930550L24RikQ99PA7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930550L24RikQ99PA7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930550L24RikQ99PA7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
4930550L24RikQ99PA7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930550L24RikQ99PA7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms