Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY1

Tirap, Toll/interleukin-1 receptor domain-containing adapter protein, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TirapQ99JY1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TirapQ99JY1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TirapQ99JY1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TirapQ99JY1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TirapQ99JY1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TirapQ99JY1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TirapQ99JY1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TirapQ99JY1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TirapQ99JY1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TirapQ99JY1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TirapQ99JY1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TirapQ99JY1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TirapQ99JY1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TirapQ99JY1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TirapQ99JY1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TirapQ99JY1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TirapQ99JY1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TirapQ99JY1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TirapQ99JY1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TirapQ99JY1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TirapQ99JY1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TirapQ99JY1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TirapQ99JY1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TirapQ99JY1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TirapQ99JY1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TirapQ99JY1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TirapQ99JY1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TirapQ99JY1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TirapQ99JY1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TirapQ99JY1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TirapQ99JY1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TirapQ99JY1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TirapQ99JY1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TirapQ99JY1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TirapQ99JY1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TirapQ99JY1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TirapQ99JY1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TirapQ99JY1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TirapQ99JY1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TirapQ99JY1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TirapQ99JY1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TirapQ99JY1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TirapQ99JY1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TirapQ99JY1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TirapQ99JY1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TirapQ99JY1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TirapQ99JY1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TirapQ99JY1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TirapQ99JY1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TirapQ99JY1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TirapQ99JY1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TirapQ99JY1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TirapQ99JY1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TirapQ99JY1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TirapQ99JY1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TirapQ99JY1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TirapQ99JY1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TirapQ99JY1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TirapQ99JY1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TirapQ99JY1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TirapQ99JY1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TirapQ99JY1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TirapQ99JY1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TirapQ99JY1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TirapQ99JY1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TirapQ99JY1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TirapQ99JY1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TirapQ99JY1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TirapQ99JY1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TirapQ99JY1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TirapQ99JY1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TirapQ99JY1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TirapQ99JY1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TirapQ99JY1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TirapQ99JY1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TirapQ99JY1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TirapQ99JY1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TirapQ99JY1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TirapQ99JY1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
TirapQ99JY1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TirapQ99JY1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TirapQ99JY1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TirapQ99JY1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TirapQ99JY1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TirapQ99JY1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TirapQ99JY1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TirapQ99JY1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TirapQ99JY1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TirapQ99JY1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TirapQ99JY1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TirapQ99JY1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TirapQ99JY1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TirapQ99JY1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TirapQ99JY1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TirapQ99JY1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TirapQ99JY1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TirapQ99JY1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TirapQ99JY1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TirapQ99JY1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TirapQ99JY1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms