Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ophn1Q99J31 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ophn1Q99J31 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ophn1Q99J31 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ophn1Q99J31 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ophn1Q99J31 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ophn1Q99J31 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ophn1Q99J31 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ophn1Q99J31 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ophn1Q99J31 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ophn1Q99J31 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ophn1Q99J31 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ophn1Q99J31 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ophn1Q99J31 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ophn1Q99J31 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ophn1Q99J31 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ophn1Q99J31 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ophn1Q99J31 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ophn1Q99J31 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ophn1Q99J31 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ophn1Q99J31 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ophn1Q99J31 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ophn1Q99J31 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ophn1Q99J31 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ophn1Q99J31 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ophn1Q99J31 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ophn1Q99J31 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ophn1Q99J31 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ophn1Q99J31 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ophn1Q99J31 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ophn1Q99J31 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ophn1Q99J31 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ophn1Q99J31 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ophn1Q99J31 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ophn1Q99J31 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ophn1Q99J31 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ophn1Q99J31 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ophn1Q99J31 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ophn1Q99J31 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ophn1Q99J31 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ophn1Q99J31 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ophn1Q99J31 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ophn1Q99J31 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ophn1Q99J31 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ophn1Q99J31 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ophn1Q99J31 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ophn1Q99J31 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ophn1Q99J31 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ophn1Q99J31 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ophn1Q99J31 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ophn1Q99J31 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ophn1Q99J31 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ophn1Q99J31 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ophn1Q99J31 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ophn1Q99J31 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ophn1Q99J31 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ophn1Q99J31 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms