Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smg8Q8VE18 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smg8Q8VE18 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smg8Q8VE18 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smg8Q8VE18 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smg8Q8VE18 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smg8Q8VE18 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Smg8Q8VE18 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smg8Q8VE18 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smg8Q8VE18 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Smg8Q8VE18 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smg8Q8VE18 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Smg8Q8VE18 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smg8Q8VE18 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smg8Q8VE18 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smg8Q8VE18 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smg8Q8VE18 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smg8Q8VE18 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smg8Q8VE18 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smg8Q8VE18 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smg8Q8VE18 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smg8Q8VE18 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smg8Q8VE18 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smg8Q8VE18 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smg8Q8VE18 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smg8Q8VE18 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Smg8Q8VE18 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smg8Q8VE18 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smg8Q8VE18 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smg8Q8VE18 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smg8Q8VE18 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smg8Q8VE18 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Smg8Q8VE18 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smg8Q8VE18 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smg8Q8VE18 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smg8Q8VE18 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smg8Q8VE18 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smg8Q8VE18 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smg8Q8VE18 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smg8Q8VE18 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smg8Q8VE18 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smg8Q8VE18 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smg8Q8VE18 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smg8Q8VE18 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smg8Q8VE18 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smg8Q8VE18 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smg8Q8VE18 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smg8Q8VE18 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smg8Q8VE18 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smg8Q8VE18 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smg8Q8VE18 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smg8Q8VE18 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smg8Q8VE18 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Smg8Q8VE18 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smg8Q8VE18 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smg8Q8VE18 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smg8Q8VE18 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smg8Q8VE18 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smg8Q8VE18 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smg8Q8VE18 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smg8Q8VE18 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Smg8Q8VE18 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smg8Q8VE18 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smg8Q8VE18 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smg8Q8VE18 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smg8Q8VE18 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smg8Q8VE18 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smg8Q8VE18 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smg8Q8VE18 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smg8Q8VE18 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smg8Q8VE18 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smg8Q8VE18 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smg8Q8VE18 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smg8Q8VE18 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smg8Q8VE18 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smg8Q8VE18 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smg8Q8VE18 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smg8Q8VE18 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smg8Q8VE18 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smg8Q8VE18 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smg8Q8VE18 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smg8Q8VE18 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smg8Q8VE18 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smg8Q8VE18 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smg8Q8VE18 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smg8Q8VE18 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smg8Q8VE18 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smg8Q8VE18 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smg8Q8VE18 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smg8Q8VE18 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smg8Q8VE18 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smg8Q8VE18 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smg8Q8VE18 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smg8Q8VE18 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Smg8Q8VE18 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smg8Q8VE18 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smg8Q8VE18 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smg8Q8VE18 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smg8Q8VE18 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smg8Q8VE18 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
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