Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GcaQ8VC88 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GcaQ8VC88 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GcaQ8VC88 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GcaQ8VC88 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GcaQ8VC88 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GcaQ8VC88 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GcaQ8VC88 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GcaQ8VC88 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GcaQ8VC88 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GcaQ8VC88 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GcaQ8VC88 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GcaQ8VC88 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GcaQ8VC88 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GcaQ8VC88 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GcaQ8VC88 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GcaQ8VC88 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GcaQ8VC88 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GcaQ8VC88 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GcaQ8VC88 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GcaQ8VC88 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GcaQ8VC88 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GcaQ8VC88 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GcaQ8VC88 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GcaQ8VC88 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GcaQ8VC88 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GcaQ8VC88 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GcaQ8VC88 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
GcaQ8VC88 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GcaQ8VC88 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GcaQ8VC88 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GcaQ8VC88 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GcaQ8VC88 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GcaQ8VC88 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GcaQ8VC88 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GcaQ8VC88 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GcaQ8VC88 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GcaQ8VC88 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GcaQ8VC88 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GcaQ8VC88 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GcaQ8VC88 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GcaQ8VC88 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GcaQ8VC88 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GcaQ8VC88 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GcaQ8VC88 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GcaQ8VC88 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GcaQ8VC88 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GcaQ8VC88 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GcaQ8VC88 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GcaQ8VC88 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GcaQ8VC88 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GcaQ8VC88 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GcaQ8VC88 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GcaQ8VC88 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GcaQ8VC88 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GcaQ8VC88 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GcaQ8VC88 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GcaQ8VC88 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GcaQ8VC88 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GcaQ8VC88 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GcaQ8VC88 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GcaQ8VC88 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GcaQ8VC88 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GcaQ8VC88 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GcaQ8VC88 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GcaQ8VC88 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GcaQ8VC88 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GcaQ8VC88 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GcaQ8VC88 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GcaQ8VC88 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GcaQ8VC88 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GcaQ8VC88 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GcaQ8VC88 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GcaQ8VC88 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GcaQ8VC88 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GcaQ8VC88 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GcaQ8VC88 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GcaQ8VC88 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GcaQ8VC88 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GcaQ8VC88 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GcaQ8VC88 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GcaQ8VC88 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GcaQ8VC88 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GcaQ8VC88 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GcaQ8VC88 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GcaQ8VC88 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GcaQ8VC88 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GcaQ8VC88 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GcaQ8VC88 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GcaQ8VC88 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GcaQ8VC88 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GcaQ8VC88 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GcaQ8VC88 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GcaQ8VC88 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GcaQ8VC88 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GcaQ8VC88 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GcaQ8VC88 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GcaQ8VC88 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GcaQ8VC88 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GcaQ8VC88 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms