Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2U2

Nepro, Nucleolus and neural progenitor protein, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeproQ8R2U2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NeproQ8R2U2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NeproQ8R2U2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NeproQ8R2U2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NeproQ8R2U2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NeproQ8R2U2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NeproQ8R2U2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NeproQ8R2U2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NeproQ8R2U2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NeproQ8R2U2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NeproQ8R2U2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NeproQ8R2U2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NeproQ8R2U2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NeproQ8R2U2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NeproQ8R2U2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NeproQ8R2U2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NeproQ8R2U2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NeproQ8R2U2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NeproQ8R2U2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NeproQ8R2U2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NeproQ8R2U2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NeproQ8R2U2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NeproQ8R2U2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NeproQ8R2U2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NeproQ8R2U2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NeproQ8R2U2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NeproQ8R2U2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NeproQ8R2U2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NeproQ8R2U2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NeproQ8R2U2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NeproQ8R2U2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NeproQ8R2U2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NeproQ8R2U2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NeproQ8R2U2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NeproQ8R2U2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NeproQ8R2U2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NeproQ8R2U2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NeproQ8R2U2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NeproQ8R2U2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NeproQ8R2U2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NeproQ8R2U2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NeproQ8R2U2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NeproQ8R2U2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NeproQ8R2U2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NeproQ8R2U2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NeproQ8R2U2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NeproQ8R2U2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NeproQ8R2U2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NeproQ8R2U2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NeproQ8R2U2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NeproQ8R2U2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NeproQ8R2U2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NeproQ8R2U2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NeproQ8R2U2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NeproQ8R2U2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NeproQ8R2U2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NeproQ8R2U2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NeproQ8R2U2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NeproQ8R2U2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NeproQ8R2U2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NeproQ8R2U2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NeproQ8R2U2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NeproQ8R2U2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NeproQ8R2U2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NeproQ8R2U2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NeproQ8R2U2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NeproQ8R2U2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NeproQ8R2U2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NeproQ8R2U2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NeproQ8R2U2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NeproQ8R2U2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NeproQ8R2U2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NeproQ8R2U2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NeproQ8R2U2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NeproQ8R2U2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NeproQ8R2U2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NeproQ8R2U2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NeproQ8R2U2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NeproQ8R2U2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NeproQ8R2U2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NeproQ8R2U2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NeproQ8R2U2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NeproQ8R2U2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NeproQ8R2U2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NeproQ8R2U2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NeproQ8R2U2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NeproQ8R2U2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NeproQ8R2U2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NeproQ8R2U2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NeproQ8R2U2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NeproQ8R2U2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NeproQ8R2U2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NeproQ8R2U2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NeproQ8R2U2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NeproQ8R2U2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NeproQ8R2U2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NeproQ8R2U2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NeproQ8R2U2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NeproQ8R2U2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NeproQ8R2U2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms