Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssh3Q8K330 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssh3Q8K330 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssh3Q8K330 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssh3Q8K330 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssh3Q8K330 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssh3Q8K330 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssh3Q8K330 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssh3Q8K330 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssh3Q8K330 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssh3Q8K330 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssh3Q8K330 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssh3Q8K330 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssh3Q8K330 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssh3Q8K330 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssh3Q8K330 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssh3Q8K330 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssh3Q8K330 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssh3Q8K330 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssh3Q8K330 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssh3Q8K330 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssh3Q8K330 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssh3Q8K330 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssh3Q8K330 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssh3Q8K330 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssh3Q8K330 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssh3Q8K330 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssh3Q8K330 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssh3Q8K330 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssh3Q8K330 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssh3Q8K330 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssh3Q8K330 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssh3Q8K330 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssh3Q8K330 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssh3Q8K330 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssh3Q8K330 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssh3Q8K330 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssh3Q8K330 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssh3Q8K330 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssh3Q8K330 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssh3Q8K330 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssh3Q8K330 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssh3Q8K330 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssh3Q8K330 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssh3Q8K330 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssh3Q8K330 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssh3Q8K330 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssh3Q8K330 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssh3Q8K330 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssh3Q8K330 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssh3Q8K330 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ssh3Q8K330 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ssh3Q8K330 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ssh3Q8K330 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ssh3Q8K330 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ssh3Q8K330 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ssh3Q8K330 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ssh3Q8K330 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssh3Q8K330 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssh3Q8K330 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssh3Q8K330 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssh3Q8K330 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssh3Q8K330 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssh3Q8K330 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssh3Q8K330 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssh3Q8K330 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssh3Q8K330 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssh3Q8K330 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssh3Q8K330 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssh3Q8K330 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssh3Q8K330 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssh3Q8K330 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssh3Q8K330 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssh3Q8K330 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssh3Q8K330 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssh3Q8K330 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssh3Q8K330 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssh3Q8K330 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssh3Q8K330 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssh3Q8K330 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssh3Q8K330 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssh3Q8K330 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssh3Q8K330 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ssh3Q8K330 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ssh3Q8K330 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ssh3Q8K330 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ssh3Q8K330 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ssh3Q8K330 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ssh3Q8K330 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ssh3Q8K330 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ssh3Q8K330 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ssh3Q8K330 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ssh3Q8K330 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssh3Q8K330 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms