Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Polr1eQ8K202 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Polr1eQ8K202 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Polr1eQ8K202 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Polr1eQ8K202 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Polr1eQ8K202 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Polr1eQ8K202 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Polr1eQ8K202 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Polr1eQ8K202 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Polr1eQ8K202 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Polr1eQ8K202 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Polr1eQ8K202 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Polr1eQ8K202 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Polr1eQ8K202 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Polr1eQ8K202 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Polr1eQ8K202 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Polr1eQ8K202 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Polr1eQ8K202 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Polr1eQ8K202 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Polr1eQ8K202 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Polr1eQ8K202 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Polr1eQ8K202 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Polr1eQ8K202 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Polr1eQ8K202 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Polr1eQ8K202 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Polr1eQ8K202 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Polr1eQ8K202 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Polr1eQ8K202 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Polr1eQ8K202 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Polr1eQ8K202 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Polr1eQ8K202 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Polr1eQ8K202 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Polr1eQ8K202 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Polr1eQ8K202 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Polr1eQ8K202 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Polr1eQ8K202 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Polr1eQ8K202 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Polr1eQ8K202 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Polr1eQ8K202 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Polr1eQ8K202 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Polr1eQ8K202 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Polr1eQ8K202 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Polr1eQ8K202 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Polr1eQ8K202 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Polr1eQ8K202 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Polr1eQ8K202 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Polr1eQ8K202 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Polr1eQ8K202 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Polr1eQ8K202 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Polr1eQ8K202 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Polr1eQ8K202 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Polr1eQ8K202 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Polr1eQ8K202 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Polr1eQ8K202 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Polr1eQ8K202 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Polr1eQ8K202 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Polr1eQ8K202 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Polr1eQ8K202 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Polr1eQ8K202 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Polr1eQ8K202 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Polr1eQ8K202 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Polr1eQ8K202 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Polr1eQ8K202 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Polr1eQ8K202 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Polr1eQ8K202 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Polr1eQ8K202 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Polr1eQ8K202 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Polr1eQ8K202 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Polr1eQ8K202 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Polr1eQ8K202 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Polr1eQ8K202 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Polr1eQ8K202 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Polr1eQ8K202 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Polr1eQ8K202 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Polr1eQ8K202 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Polr1eQ8K202 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Polr1eQ8K202 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Polr1eQ8K202 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Polr1eQ8K202 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Polr1eQ8K202 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Polr1eQ8K202 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Polr1eQ8K202 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Polr1eQ8K202 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Polr1eQ8K202 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Polr1eQ8K202 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Polr1eQ8K202 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Polr1eQ8K202 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Polr1eQ8K202 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Polr1eQ8K202 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Polr1eQ8K202 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr1eQ8K202 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr1eQ8K202 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr1eQ8K202 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr1eQ8K202 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Polr1eQ8K202 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Polr1eQ8K202 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Polr1eQ8K202 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Polr1eQ8K202 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr1eQ8K202 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr1eQ8K202 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms