Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R3

Pnpt1, Polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpt1Q8K1R3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pnpt1Q8K1R3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pnpt1Q8K1R3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pnpt1Q8K1R3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pnpt1Q8K1R3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pnpt1Q8K1R3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pnpt1Q8K1R3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pnpt1Q8K1R3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pnpt1Q8K1R3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pnpt1Q8K1R3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pnpt1Q8K1R3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pnpt1Q8K1R3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pnpt1Q8K1R3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pnpt1Q8K1R3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pnpt1Q8K1R3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pnpt1Q8K1R3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pnpt1Q8K1R3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pnpt1Q8K1R3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pnpt1Q8K1R3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pnpt1Q8K1R3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pnpt1Q8K1R3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pnpt1Q8K1R3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pnpt1Q8K1R3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pnpt1Q8K1R3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pnpt1Q8K1R3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pnpt1Q8K1R3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pnpt1Q8K1R3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pnpt1Q8K1R3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnpt1Q8K1R3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnpt1Q8K1R3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnpt1Q8K1R3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pnpt1Q8K1R3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pnpt1Q8K1R3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pnpt1Q8K1R3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pnpt1Q8K1R3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pnpt1Q8K1R3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pnpt1Q8K1R3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pnpt1Q8K1R3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pnpt1Q8K1R3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pnpt1Q8K1R3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pnpt1Q8K1R3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pnpt1Q8K1R3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pnpt1Q8K1R3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pnpt1Q8K1R3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pnpt1Q8K1R3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pnpt1Q8K1R3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pnpt1Q8K1R3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pnpt1Q8K1R3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pnpt1Q8K1R3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pnpt1Q8K1R3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pnpt1Q8K1R3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pnpt1Q8K1R3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pnpt1Q8K1R3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pnpt1Q8K1R3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pnpt1Q8K1R3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pnpt1Q8K1R3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pnpt1Q8K1R3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pnpt1Q8K1R3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pnpt1Q8K1R3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pnpt1Q8K1R3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pnpt1Q8K1R3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pnpt1Q8K1R3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pnpt1Q8K1R3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pnpt1Q8K1R3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pnpt1Q8K1R3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pnpt1Q8K1R3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pnpt1Q8K1R3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pnpt1Q8K1R3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pnpt1Q8K1R3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pnpt1Q8K1R3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pnpt1Q8K1R3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pnpt1Q8K1R3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pnpt1Q8K1R3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pnpt1Q8K1R3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pnpt1Q8K1R3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pnpt1Q8K1R3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pnpt1Q8K1R3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pnpt1Q8K1R3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pnpt1Q8K1R3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pnpt1Q8K1R3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pnpt1Q8K1R3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pnpt1Q8K1R3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pnpt1Q8K1R3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pnpt1Q8K1R3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pnpt1Q8K1R3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pnpt1Q8K1R3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pnpt1Q8K1R3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pnpt1Q8K1R3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pnpt1Q8K1R3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pnpt1Q8K1R3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pnpt1Q8K1R3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pnpt1Q8K1R3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pnpt1Q8K1R3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pnpt1Q8K1R3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pnpt1Q8K1R3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pnpt1Q8K1R3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pnpt1Q8K1R3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pnpt1Q8K1R3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pnpt1Q8K1R3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pnpt1Q8K1R3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.9 ms