Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ercc8Q8CFD5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc8Q8CFD5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.6 ms