Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC96

Uncharacterized protein C6orf222 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CC96 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q8CC96 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q8CC96 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q8CC96 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q8CC96 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q8CC96 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q8CC96 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q8CC96 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q8CC96 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q8CC96 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q8CC96 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q8CC96 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q8CC96 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q8CC96 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q8CC96 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q8CC96 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q8CC96 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q8CC96 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q8CC96 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q8CC96 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q8CC96 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q8CC96 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q8CC96 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q8CC96 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q8CC96 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q8CC96 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q8CC96 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q8CC96 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q8CC96 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q8CC96 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q8CC96 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q8CC96 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q8CC96 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q8CC96 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q8CC96 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q8CC96 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q8CC96 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q8CC96 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q8CC96 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q8CC96 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q8CC96 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q8CC96 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q8CC96 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q8CC96 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q8CC96 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q8CC96 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q8CC96 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q8CC96 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q8CC96 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q8CC96 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8CC96 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8CC96 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8CC96 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8CC96 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q8CC96 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q8CC96 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q8CC96 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q8CC96 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q8CC96 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q8CC96 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q8CC96 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q8CC96 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q8CC96 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q8CC96 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q8CC96 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Q8CC96 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q8CC96 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q8CC96 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q8CC96 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q8CC96 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q8CC96 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q8CC96 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q8CC96 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q8CC96 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q8CC96 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Q8CC96 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q8CC96 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q8CC96 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q8CC96 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q8CC96 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Q8CC96 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q8CC96 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q8CC96 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q8CC96 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q8CC96 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q8CC96 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q8CC96 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q8CC96 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q8CC96 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q8CC96 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q8CC96 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8CC96 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8CC96 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8CC96 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8CC96 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8CC96 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8CC96 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8CC96 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q8CC96 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q8CC96 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms