Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc15Q8C9M2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc15Q8C9M2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc15Q8C9M2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc15Q8C9M2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc15Q8C9M2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc15Q8C9M2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc15Q8C9M2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc15Q8C9M2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc15Q8C9M2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc15Q8C9M2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc15Q8C9M2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc15Q8C9M2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc15Q8C9M2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc15Q8C9M2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc15Q8C9M2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc15Q8C9M2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc15Q8C9M2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc15Q8C9M2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc15Q8C9M2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc15Q8C9M2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc15Q8C9M2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc15Q8C9M2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc15Q8C9M2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc15Q8C9M2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc15Q8C9M2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc15Q8C9M2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc15Q8C9M2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc15Q8C9M2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc15Q8C9M2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc15Q8C9M2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc15Q8C9M2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc15Q8C9M2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc15Q8C9M2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc15Q8C9M2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc15Q8C9M2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc15Q8C9M2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc15Q8C9M2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc15Q8C9M2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc15Q8C9M2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc15Q8C9M2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc15Q8C9M2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc15Q8C9M2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc15Q8C9M2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc15Q8C9M2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc15Q8C9M2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc15Q8C9M2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc15Q8C9M2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc15Q8C9M2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc15Q8C9M2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc15Q8C9M2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc15Q8C9M2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc15Q8C9M2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc15Q8C9M2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc15Q8C9M2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc15Q8C9M2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc15Q8C9M2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc15Q8C9M2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc15Q8C9M2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc15Q8C9M2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc15Q8C9M2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc15Q8C9M2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc15Q8C9M2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc15Q8C9M2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc15Q8C9M2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc15Q8C9M2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc15Q8C9M2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc15Q8C9M2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc15Q8C9M2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc15Q8C9M2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc15Q8C9M2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc15Q8C9M2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc15Q8C9M2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc15Q8C9M2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc15Q8C9M2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc15Q8C9M2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc15Q8C9M2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc15Q8C9M2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc15Q8C9M2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc15Q8C9M2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc15Q8C9M2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc15Q8C9M2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc15Q8C9M2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc15Q8C9M2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc15Q8C9M2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc15Q8C9M2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc15Q8C9M2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc15Q8C9M2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc15Q8C9M2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc15Q8C9M2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc15Q8C9M2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc15Q8C9M2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc15Q8C9M2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc15Q8C9M2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc15Q8C9M2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc15Q8C9M2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc15Q8C9M2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms