Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubqln3Q8C5U9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubqln3Q8C5U9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubqln3Q8C5U9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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Ubqln3Q8C5U9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubqln3Q8C5U9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubqln3Q8C5U9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubqln3Q8C5U9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubqln3Q8C5U9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubqln3Q8C5U9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubqln3Q8C5U9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubqln3Q8C5U9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubqln3Q8C5U9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubqln3Q8C5U9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubqln3Q8C5U9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubqln3Q8C5U9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubqln3Q8C5U9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubqln3Q8C5U9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubqln3Q8C5U9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubqln3Q8C5U9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubqln3Q8C5U9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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Ubqln3Q8C5U9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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Ubqln3Q8C5U9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubqln3Q8C5U9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubqln3Q8C5U9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubqln3Q8C5U9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubqln3Q8C5U9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubqln3Q8C5U9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubqln3Q8C5U9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubqln3Q8C5U9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubqln3Q8C5U9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubqln3Q8C5U9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubqln3Q8C5U9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubqln3Q8C5U9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubqln3Q8C5U9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubqln3Q8C5U9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubqln3Q8C5U9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubqln3Q8C5U9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubqln3Q8C5U9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubqln3Q8C5U9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubqln3Q8C5U9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubqln3Q8C5U9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubqln3Q8C5U9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubqln3Q8C5U9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ubqln3Q8C5U9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubqln3Q8C5U9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubqln3Q8C5U9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubqln3Q8C5U9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubqln3Q8C5U9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubqln3Q8C5U9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubqln3Q8C5U9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubqln3Q8C5U9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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