Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx16Q8C080 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx16Q8C080 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snx16Q8C080 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx16Q8C080 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx16Q8C080 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx16Q8C080 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx16Q8C080 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx16Q8C080 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx16Q8C080 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx16Q8C080 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx16Q8C080 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx16Q8C080 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx16Q8C080 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx16Q8C080 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx16Q8C080 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx16Q8C080 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx16Q8C080 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx16Q8C080 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx16Q8C080 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx16Q8C080 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx16Q8C080 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx16Q8C080 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx16Q8C080 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx16Q8C080 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx16Q8C080 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx16Q8C080 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx16Q8C080 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx16Q8C080 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx16Q8C080 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx16Q8C080 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx16Q8C080 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx16Q8C080 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx16Q8C080 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx16Q8C080 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx16Q8C080 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx16Q8C080 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx16Q8C080 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx16Q8C080 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx16Q8C080 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx16Q8C080 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx16Q8C080 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx16Q8C080 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx16Q8C080 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx16Q8C080 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx16Q8C080 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx16Q8C080 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx16Q8C080 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx16Q8C080 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx16Q8C080 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx16Q8C080 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx16Q8C080 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx16Q8C080 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx16Q8C080 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx16Q8C080 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx16Q8C080 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx16Q8C080 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx16Q8C080 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx16Q8C080 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx16Q8C080 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx16Q8C080 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx16Q8C080 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx16Q8C080 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx16Q8C080 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx16Q8C080 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx16Q8C080 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx16Q8C080 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx16Q8C080 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx16Q8C080 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx16Q8C080 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx16Q8C080 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx16Q8C080 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx16Q8C080 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx16Q8C080 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx16Q8C080 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx16Q8C080 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx16Q8C080 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx16Q8C080 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx16Q8C080 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx16Q8C080 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx16Q8C080 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx16Q8C080 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx16Q8C080 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx16Q8C080 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx16Q8C080 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx16Q8C080 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx16Q8C080 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx16Q8C080 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx16Q8C080 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx16Q8C080 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx16Q8C080 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx16Q8C080 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx16Q8C080 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx16Q8C080 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx16Q8C080 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx16Q8C080 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx16Q8C080 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx16Q8C080 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snx16Q8C080 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snx16Q8C080 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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