Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Kdm4aQ8BW72 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Kdm4aQ8BW72 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Kdm4aQ8BW72 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Kdm4aQ8BW72 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Kdm4aQ8BW72 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Kdm4aQ8BW72 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kdm4aQ8BW72 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kdm4aQ8BW72 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kdm4aQ8BW72 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kdm4aQ8BW72 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kdm4aQ8BW72 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm4aQ8BW72 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm4aQ8BW72 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm4aQ8BW72 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm4aQ8BW72 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm4aQ8BW72 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm4aQ8BW72 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm4aQ8BW72 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm4aQ8BW72 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm4aQ8BW72 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm4aQ8BW72 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm4aQ8BW72 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm4aQ8BW72 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm4aQ8BW72 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kdm4aQ8BW72 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm4aQ8BW72 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm4aQ8BW72 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm4aQ8BW72 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm4aQ8BW72 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm4aQ8BW72 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kdm4aQ8BW72 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kdm4aQ8BW72 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kdm4aQ8BW72 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kdm4aQ8BW72 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kdm4aQ8BW72 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kdm4aQ8BW72 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kdm4aQ8BW72 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kdm4aQ8BW72 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kdm4aQ8BW72 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kdm4aQ8BW72 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kdm4aQ8BW72 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kdm4aQ8BW72 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kdm4aQ8BW72 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kdm4aQ8BW72 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kdm4aQ8BW72 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kdm4aQ8BW72 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kdm4aQ8BW72 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kdm4aQ8BW72 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kdm4aQ8BW72 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kdm4aQ8BW72 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kdm4aQ8BW72 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm4aQ8BW72 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm4aQ8BW72 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm4aQ8BW72 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm4aQ8BW72 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm4aQ8BW72 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kdm4aQ8BW72 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kdm4aQ8BW72 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kdm4aQ8BW72 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kdm4aQ8BW72 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kdm4aQ8BW72 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kdm4aQ8BW72 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kdm4aQ8BW72 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kdm4aQ8BW72 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kdm4aQ8BW72 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kdm4aQ8BW72 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kdm4aQ8BW72 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Kdm4aQ8BW72 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kdm4aQ8BW72 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kdm4aQ8BW72 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kdm4aQ8BW72 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kdm4aQ8BW72 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kdm4aQ8BW72 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Kdm4aQ8BW72 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kdm4aQ8BW72 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kdm4aQ8BW72 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kdm4aQ8BW72 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kdm4aQ8BW72 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kdm4aQ8BW72 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kdm4aQ8BW72 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Kdm4aQ8BW72 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kdm4aQ8BW72 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kdm4aQ8BW72 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kdm4aQ8BW72 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Kdm4aQ8BW72 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kdm4aQ8BW72 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kdm4aQ8BW72 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kdm4aQ8BW72 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kdm4aQ8BW72 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm4aQ8BW72 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm4aQ8BW72 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm4aQ8BW72 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm4aQ8BW72 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm4aQ8BW72 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm4aQ8BW72 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kdm4aQ8BW72 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kdm4aQ8BW72 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kdm4aQ8BW72 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kdm4aQ8BW72 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms