Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup54Q8BTS4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup54Q8BTS4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup54Q8BTS4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup54Q8BTS4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup54Q8BTS4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup54Q8BTS4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup54Q8BTS4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup54Q8BTS4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup54Q8BTS4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup54Q8BTS4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup54Q8BTS4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup54Q8BTS4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup54Q8BTS4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup54Q8BTS4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup54Q8BTS4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup54Q8BTS4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup54Q8BTS4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup54Q8BTS4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup54Q8BTS4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup54Q8BTS4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup54Q8BTS4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup54Q8BTS4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup54Q8BTS4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup54Q8BTS4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup54Q8BTS4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup54Q8BTS4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup54Q8BTS4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup54Q8BTS4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup54Q8BTS4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup54Q8BTS4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup54Q8BTS4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup54Q8BTS4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup54Q8BTS4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup54Q8BTS4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup54Q8BTS4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup54Q8BTS4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup54Q8BTS4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup54Q8BTS4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup54Q8BTS4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup54Q8BTS4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup54Q8BTS4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup54Q8BTS4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup54Q8BTS4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nup54Q8BTS4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup54Q8BTS4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup54Q8BTS4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup54Q8BTS4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup54Q8BTS4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup54Q8BTS4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup54Q8BTS4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup54Q8BTS4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup54Q8BTS4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup54Q8BTS4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup54Q8BTS4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup54Q8BTS4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup54Q8BTS4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup54Q8BTS4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup54Q8BTS4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup54Q8BTS4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup54Q8BTS4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup54Q8BTS4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup54Q8BTS4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup54Q8BTS4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup54Q8BTS4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup54Q8BTS4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup54Q8BTS4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup54Q8BTS4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup54Q8BTS4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup54Q8BTS4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup54Q8BTS4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup54Q8BTS4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup54Q8BTS4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup54Q8BTS4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup54Q8BTS4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup54Q8BTS4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nup54Q8BTS4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nup54Q8BTS4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Nup54Q8BTS4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup54Q8BTS4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup54Q8BTS4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup54Q8BTS4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup54Q8BTS4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup54Q8BTS4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup54Q8BTS4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup54Q8BTS4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup54Q8BTS4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup54Q8BTS4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup54Q8BTS4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup54Q8BTS4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup54Q8BTS4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup54Q8BTS4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup54Q8BTS4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup54Q8BTS4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup54Q8BTS4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup54Q8BTS4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup54Q8BTS4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup54Q8BTS4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup54Q8BTS4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup54Q8BTS4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms