Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grik4Q8BMF5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grik4Q8BMF5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grik4Q8BMF5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grik4Q8BMF5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grik4Q8BMF5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Grik4Q8BMF5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grik4Q8BMF5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grik4Q8BMF5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grik4Q8BMF5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grik4Q8BMF5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grik4Q8BMF5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grik4Q8BMF5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grik4Q8BMF5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grik4Q8BMF5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grik4Q8BMF5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grik4Q8BMF5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grik4Q8BMF5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grik4Q8BMF5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grik4Q8BMF5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grik4Q8BMF5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grik4Q8BMF5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grik4Q8BMF5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grik4Q8BMF5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Grik4Q8BMF5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grik4Q8BMF5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grik4Q8BMF5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grik4Q8BMF5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grik4Q8BMF5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grik4Q8BMF5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grik4Q8BMF5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grik4Q8BMF5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grik4Q8BMF5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Grik4Q8BMF5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Grik4Q8BMF5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Grik4Q8BMF5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Grik4Q8BMF5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Grik4Q8BMF5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Grik4Q8BMF5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Grik4Q8BMF5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Grik4Q8BMF5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Grik4Q8BMF5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Grik4Q8BMF5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Grik4Q8BMF5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Grik4Q8BMF5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Grik4Q8BMF5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Grik4Q8BMF5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Grik4Q8BMF5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Grik4Q8BMF5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Grik4Q8BMF5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Grik4Q8BMF5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Grik4Q8BMF5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Grik4Q8BMF5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Grik4Q8BMF5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Grik4Q8BMF5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Grik4Q8BMF5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Grik4Q8BMF5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Grik4Q8BMF5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grik4Q8BMF5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grik4Q8BMF5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grik4Q8BMF5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grik4Q8BMF5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grik4Q8BMF5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grik4Q8BMF5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grik4Q8BMF5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grik4Q8BMF5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grik4Q8BMF5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grik4Q8BMF5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grik4Q8BMF5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Grik4Q8BMF5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Grik4Q8BMF5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Grik4Q8BMF5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Grik4Q8BMF5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Grik4Q8BMF5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grik4Q8BMF5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grik4Q8BMF5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grik4Q8BMF5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Grik4Q8BMF5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grik4Q8BMF5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grik4Q8BMF5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Grik4Q8BMF5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Grik4Q8BMF5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Grik4Q8BMF5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grik4Q8BMF5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grik4Q8BMF5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grik4Q8BMF5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grik4Q8BMF5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Grik4Q8BMF5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Grik4Q8BMF5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Grik4Q8BMF5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grik4Q8BMF5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grik4Q8BMF5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grik4Q8BMF5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Grik4Q8BMF5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grik4Q8BMF5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grik4Q8BMF5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Grik4Q8BMF5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Grik4Q8BMF5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Grik4Q8BMF5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Grik4Q8BMF5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms