Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJX2

6820408C15Rik, RIKEN cDNA 6820408C15, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6820408C15RikQ8BJX2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
6820408C15RikQ8BJX2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
6820408C15RikQ8BJX2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
6820408C15RikQ8BJX2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
6820408C15RikQ8BJX2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
6820408C15RikQ8BJX2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
6820408C15RikQ8BJX2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
6820408C15RikQ8BJX2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
6820408C15RikQ8BJX2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
6820408C15RikQ8BJX2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
6820408C15RikQ8BJX2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
6820408C15RikQ8BJX2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
6820408C15RikQ8BJX2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
6820408C15RikQ8BJX2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
6820408C15RikQ8BJX2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
6820408C15RikQ8BJX2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
6820408C15RikQ8BJX2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
6820408C15RikQ8BJX2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
6820408C15RikQ8BJX2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
6820408C15RikQ8BJX2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
6820408C15RikQ8BJX2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
6820408C15RikQ8BJX2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
6820408C15RikQ8BJX2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
6820408C15RikQ8BJX2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
6820408C15RikQ8BJX2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
6820408C15RikQ8BJX2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
6820408C15RikQ8BJX2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
6820408C15RikQ8BJX2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
6820408C15RikQ8BJX2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
6820408C15RikQ8BJX2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
6820408C15RikQ8BJX2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
6820408C15RikQ8BJX2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
6820408C15RikQ8BJX2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
6820408C15RikQ8BJX2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
6820408C15RikQ8BJX2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
6820408C15RikQ8BJX2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
6820408C15RikQ8BJX2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
6820408C15RikQ8BJX2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
6820408C15RikQ8BJX2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
6820408C15RikQ8BJX2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
6820408C15RikQ8BJX2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
6820408C15RikQ8BJX2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
6820408C15RikQ8BJX2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
6820408C15RikQ8BJX2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
6820408C15RikQ8BJX2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
6820408C15RikQ8BJX2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
6820408C15RikQ8BJX2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
6820408C15RikQ8BJX2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
6820408C15RikQ8BJX2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
6820408C15RikQ8BJX2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
6820408C15RikQ8BJX2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
6820408C15RikQ8BJX2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms