Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH66

Atl1, Atlastin-1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl1Q8BH66 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atl1Q8BH66 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atl1Q8BH66 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atl1Q8BH66 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atl1Q8BH66 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atl1Q8BH66 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atl1Q8BH66 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atl1Q8BH66 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atl1Q8BH66 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atl1Q8BH66 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atl1Q8BH66 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atl1Q8BH66 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atl1Q8BH66 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atl1Q8BH66 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atl1Q8BH66 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atl1Q8BH66 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atl1Q8BH66 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atl1Q8BH66 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atl1Q8BH66 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Atl1Q8BH66 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atl1Q8BH66 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atl1Q8BH66 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atl1Q8BH66 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atl1Q8BH66 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atl1Q8BH66 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atl1Q8BH66 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atl1Q8BH66 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atl1Q8BH66 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atl1Q8BH66 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atl1Q8BH66 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atl1Q8BH66 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atl1Q8BH66 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atl1Q8BH66 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atl1Q8BH66 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atl1Q8BH66 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atl1Q8BH66 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atl1Q8BH66 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Atl1Q8BH66 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Atl1Q8BH66 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atl1Q8BH66 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atl1Q8BH66 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atl1Q8BH66 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atl1Q8BH66 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atl1Q8BH66 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atl1Q8BH66 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atl1Q8BH66 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atl1Q8BH66 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atl1Q8BH66 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atl1Q8BH66 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atl1Q8BH66 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atl1Q8BH66 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atl1Q8BH66 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atl1Q8BH66 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atl1Q8BH66 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atl1Q8BH66 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atl1Q8BH66 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atl1Q8BH66 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atl1Q8BH66 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atl1Q8BH66 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Atl1Q8BH66 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atl1Q8BH66 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atl1Q8BH66 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Atl1Q8BH66 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Atl1Q8BH66 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atl1Q8BH66 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atl1Q8BH66 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atl1Q8BH66 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atl1Q8BH66 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atl1Q8BH66 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atl1Q8BH66 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atl1Q8BH66 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Atl1Q8BH66 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atl1Q8BH66 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atl1Q8BH66 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atl1Q8BH66 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atl1Q8BH66 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Atl1Q8BH66 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atl1Q8BH66 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atl1Q8BH66 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atl1Q8BH66 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atl1Q8BH66 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atl1Q8BH66 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atl1Q8BH66 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atl1Q8BH66 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Atl1Q8BH66 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atl1Q8BH66 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atl1Q8BH66 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Atl1Q8BH66 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atl1Q8BH66 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atl1Q8BH66 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atl1Q8BH66 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atl1Q8BH66 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atl1Q8BH66 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atl1Q8BH66 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atl1Q8BH66 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atl1Q8BH66 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atl1Q8BH66 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atl1Q8BH66 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atl1Q8BH66 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atl1Q8BH66 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms