Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ6

Zer1, Protein zer-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zer1Q80ZJ6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zer1Q80ZJ6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zer1Q80ZJ6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms