Protein–RNA interactions for Protein: Q80UN9

Trit1, tRNA dimethylallyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trit1Q80UN9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trit1Q80UN9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trit1Q80UN9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trit1Q80UN9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trit1Q80UN9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trit1Q80UN9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trit1Q80UN9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trit1Q80UN9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trit1Q80UN9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trit1Q80UN9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trit1Q80UN9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trit1Q80UN9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trit1Q80UN9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trit1Q80UN9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trit1Q80UN9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trit1Q80UN9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trit1Q80UN9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trit1Q80UN9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trit1Q80UN9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trit1Q80UN9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trit1Q80UN9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trit1Q80UN9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trit1Q80UN9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trit1Q80UN9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trit1Q80UN9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trit1Q80UN9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trit1Q80UN9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trit1Q80UN9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Trit1Q80UN9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trit1Q80UN9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trit1Q80UN9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trit1Q80UN9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trit1Q80UN9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trit1Q80UN9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trit1Q80UN9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trit1Q80UN9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trit1Q80UN9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trit1Q80UN9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trit1Q80UN9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trit1Q80UN9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trit1Q80UN9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trit1Q80UN9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trit1Q80UN9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trit1Q80UN9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trit1Q80UN9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trit1Q80UN9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trit1Q80UN9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trit1Q80UN9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trit1Q80UN9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trit1Q80UN9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trit1Q80UN9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trit1Q80UN9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trit1Q80UN9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trit1Q80UN9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trit1Q80UN9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trit1Q80UN9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trit1Q80UN9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trit1Q80UN9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trit1Q80UN9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trit1Q80UN9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trit1Q80UN9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trit1Q80UN9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trit1Q80UN9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trit1Q80UN9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trit1Q80UN9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trit1Q80UN9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trit1Q80UN9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trit1Q80UN9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trit1Q80UN9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trit1Q80UN9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trit1Q80UN9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trit1Q80UN9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trit1Q80UN9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trit1Q80UN9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trit1Q80UN9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trit1Q80UN9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trit1Q80UN9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trit1Q80UN9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trit1Q80UN9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trit1Q80UN9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trit1Q80UN9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trit1Q80UN9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trit1Q80UN9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trit1Q80UN9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trit1Q80UN9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trit1Q80UN9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trit1Q80UN9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Trit1Q80UN9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trit1Q80UN9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trit1Q80UN9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trit1Q80UN9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trit1Q80UN9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trit1Q80UN9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trit1Q80UN9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trit1Q80UN9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Trit1Q80UN9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trit1Q80UN9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trit1Q80UN9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trit1Q80UN9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trit1Q80UN9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.5 ms