Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc93Q7TQK5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc93Q7TQK5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc93Q7TQK5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc93Q7TQK5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc93Q7TQK5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc93Q7TQK5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc93Q7TQK5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc93Q7TQK5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc93Q7TQK5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc93Q7TQK5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc93Q7TQK5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc93Q7TQK5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc93Q7TQK5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc93Q7TQK5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc93Q7TQK5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc93Q7TQK5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc93Q7TQK5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc93Q7TQK5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc93Q7TQK5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc93Q7TQK5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc93Q7TQK5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc93Q7TQK5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc93Q7TQK5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc93Q7TQK5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc93Q7TQK5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc93Q7TQK5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc93Q7TQK5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc93Q7TQK5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc93Q7TQK5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc93Q7TQK5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc93Q7TQK5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc93Q7TQK5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc93Q7TQK5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc93Q7TQK5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc93Q7TQK5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc93Q7TQK5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc93Q7TQK5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc93Q7TQK5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc93Q7TQK5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc93Q7TQK5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc93Q7TQK5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc93Q7TQK5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc93Q7TQK5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc93Q7TQK5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc93Q7TQK5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc93Q7TQK5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc93Q7TQK5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc93Q7TQK5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc93Q7TQK5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc93Q7TQK5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc93Q7TQK5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc93Q7TQK5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc93Q7TQK5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc93Q7TQK5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc93Q7TQK5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc93Q7TQK5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc93Q7TQK5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc93Q7TQK5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc93Q7TQK5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc93Q7TQK5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc93Q7TQK5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc93Q7TQK5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc93Q7TQK5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc93Q7TQK5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc93Q7TQK5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc93Q7TQK5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc93Q7TQK5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc93Q7TQK5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc93Q7TQK5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc93Q7TQK5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc93Q7TQK5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc93Q7TQK5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc93Q7TQK5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc93Q7TQK5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc93Q7TQK5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc93Q7TQK5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc93Q7TQK5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc93Q7TQK5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc93Q7TQK5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc93Q7TQK5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc93Q7TQK5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc93Q7TQK5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc93Q7TQK5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc93Q7TQK5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc93Q7TQK5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc93Q7TQK5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc93Q7TQK5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc93Q7TQK5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc93Q7TQK5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc93Q7TQK5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc93Q7TQK5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc93Q7TQK5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc93Q7TQK5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc93Q7TQK5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc93Q7TQK5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc93Q7TQK5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc93Q7TQK5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc93Q7TQK5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc93Q7TQK5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms