Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn4bQ7M729 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn4bQ7M729 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn4bQ7M729 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn4bQ7M729 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn4bQ7M729 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn4bQ7M729 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn4bQ7M729 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn4bQ7M729 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn4bQ7M729 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn4bQ7M729 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn4bQ7M729 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn4bQ7M729 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn4bQ7M729 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn4bQ7M729 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn4bQ7M729 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn4bQ7M729 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn4bQ7M729 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn4bQ7M729 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn4bQ7M729 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn4bQ7M729 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn4bQ7M729 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn4bQ7M729 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn4bQ7M729 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn4bQ7M729 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn4bQ7M729 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn4bQ7M729 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn4bQ7M729 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn4bQ7M729 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn4bQ7M729 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn4bQ7M729 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scn4bQ7M729 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Scn4bQ7M729 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scn4bQ7M729 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scn4bQ7M729 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scn4bQ7M729 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scn4bQ7M729 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scn4bQ7M729 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scn4bQ7M729 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scn4bQ7M729 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scn4bQ7M729 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scn4bQ7M729 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scn4bQ7M729 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Scn4bQ7M729 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scn4bQ7M729 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scn4bQ7M729 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Scn4bQ7M729 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scn4bQ7M729 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scn4bQ7M729 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scn4bQ7M729 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scn4bQ7M729 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scn4bQ7M729 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scn4bQ7M729 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scn4bQ7M729 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scn4bQ7M729 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scn4bQ7M729 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scn4bQ7M729 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scn4bQ7M729 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scn4bQ7M729 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Scn4bQ7M729 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scn4bQ7M729 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scn4bQ7M729 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scn4bQ7M729 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scn4bQ7M729 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn4bQ7M729 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn4bQ7M729 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn4bQ7M729 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn4bQ7M729 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn4bQ7M729 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn4bQ7M729 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn4bQ7M729 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn4bQ7M729 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn4bQ7M729 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn4bQ7M729 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn4bQ7M729 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn4bQ7M729 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn4bQ7M729 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scn4bQ7M729 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scn4bQ7M729 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scn4bQ7M729 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scn4bQ7M729 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scn4bQ7M729 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scn4bQ7M729 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scn4bQ7M729 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scn4bQ7M729 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scn4bQ7M729 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scn4bQ7M729 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scn4bQ7M729 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scn4bQ7M729 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scn4bQ7M729 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scn4bQ7M729 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scn4bQ7M729 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scn4bQ7M729 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scn4bQ7M729 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scn4bQ7M729 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scn4bQ7M729 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scn4bQ7M729 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Scn4bQ7M729 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scn4bQ7M729 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Scn4bQ7M729 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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