Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
Rhox8Q6VSS7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
Rhox8Q6VSS7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
Rhox8Q6VSS7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC41.96■■■■■ 4.31
Rhox8Q6VSS7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
Rhox8Q6VSS7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
Rhox8Q6VSS7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
Rhox8Q6VSS7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
Rhox8Q6VSS7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
Rhox8Q6VSS7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
Rhox8Q6VSS7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC41.95■■■■■ 4.31
Rhox8Q6VSS7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
Rhox8Q6VSS7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
Rhox8Q6VSS7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC41.94■■■■■ 4.3
Rhox8Q6VSS7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
Rhox8Q6VSS7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Rhox8Q6VSS7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Rhox8Q6VSS7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Rhox8Q6VSS7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
Rhox8Q6VSS7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.91■■■■■ 4.3
Rhox8Q6VSS7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
Rhox8Q6VSS7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC41.9■■■■■ 4.3
Rhox8Q6VSS7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
Rhox8Q6VSS7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
Rhox8Q6VSS7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
Rhox8Q6VSS7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
Rhox8Q6VSS7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
Rhox8Q6VSS7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
Rhox8Q6VSS7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.29
Rhox8Q6VSS7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
Rhox8Q6VSS7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
Rhox8Q6VSS7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
Rhox8Q6VSS7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
Rhox8Q6VSS7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC41.87■■■■■ 4.29
Rhox8Q6VSS7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
Rhox8Q6VSS7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
Rhox8Q6VSS7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC41.86■■■■■ 4.29
Rhox8Q6VSS7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
Rhox8Q6VSS7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC41.85■■■■■ 4.29
Rhox8Q6VSS7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
Rhox8Q6VSS7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
Rhox8Q6VSS7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
Rhox8Q6VSS7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
Rhox8Q6VSS7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
Rhox8Q6VSS7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
Rhox8Q6VSS7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
Rhox8Q6VSS7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
Rhox8Q6VSS7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Rhox8Q6VSS7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Rhox8Q6VSS7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Rhox8Q6VSS7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC41.81■■■■■ 4.28
Rhox8Q6VSS7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Rhox8Q6VSS7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
Rhox8Q6VSS7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC41.8■■■■■ 4.28
Rhox8Q6VSS7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
Rhox8Q6VSS7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
Rhox8Q6VSS7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
Rhox8Q6VSS7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.79■■■■■ 4.28
Rhox8Q6VSS7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
Rhox8Q6VSS7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
Rhox8Q6VSS7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC41.79■■■■■ 4.28
Rhox8Q6VSS7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC41.78■■■■■ 4.28
Rhox8Q6VSS7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Rhox8Q6VSS7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Rhox8Q6VSS7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Rhox8Q6VSS7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
Rhox8Q6VSS7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Rhox8Q6VSS7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Rhox8Q6VSS7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
Rhox8Q6VSS7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Rhox8Q6VSS7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
Rhox8Q6VSS7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
Rhox8Q6VSS7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
Rhox8Q6VSS7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
Rhox8Q6VSS7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
Rhox8Q6VSS7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC41.73■■■■■ 4.27
Rhox8Q6VSS7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
Rhox8Q6VSS7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
Rhox8Q6VSS7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC41.72■■■■■ 4.27
Rhox8Q6VSS7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC41.72■■■■■ 4.27
Rhox8Q6VSS7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
Rhox8Q6VSS7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
Rhox8Q6VSS7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
Rhox8Q6VSS7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
Rhox8Q6VSS7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
Rhox8Q6VSS7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
Rhox8Q6VSS7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
Rhox8Q6VSS7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.68■■■■■ 4.26
Rhox8Q6VSS7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Rhox8Q6VSS7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Rhox8Q6VSS7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC41.68■■■■■ 4.26
Rhox8Q6VSS7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC41.68■■■■■ 4.26
Rhox8Q6VSS7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC41.68■■■■■ 4.26
Rhox8Q6VSS7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
Rhox8Q6VSS7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
Rhox8Q6VSS7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
Rhox8Q6VSS7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.65■■■■■ 4.26
Rhox8Q6VSS7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
Rhox8Q6VSS7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
Rhox8Q6VSS7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms