Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AtminQ6P9S1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AtminQ6P9S1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AtminQ6P9S1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AtminQ6P9S1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AtminQ6P9S1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AtminQ6P9S1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AtminQ6P9S1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AtminQ6P9S1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AtminQ6P9S1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AtminQ6P9S1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AtminQ6P9S1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AtminQ6P9S1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AtminQ6P9S1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AtminQ6P9S1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AtminQ6P9S1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AtminQ6P9S1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AtminQ6P9S1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AtminQ6P9S1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
AtminQ6P9S1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AtminQ6P9S1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AtminQ6P9S1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AtminQ6P9S1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AtminQ6P9S1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AtminQ6P9S1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AtminQ6P9S1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AtminQ6P9S1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AtminQ6P9S1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AtminQ6P9S1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AtminQ6P9S1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AtminQ6P9S1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AtminQ6P9S1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AtminQ6P9S1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AtminQ6P9S1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AtminQ6P9S1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AtminQ6P9S1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AtminQ6P9S1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AtminQ6P9S1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AtminQ6P9S1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AtminQ6P9S1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AtminQ6P9S1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AtminQ6P9S1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AtminQ6P9S1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AtminQ6P9S1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AtminQ6P9S1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AtminQ6P9S1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AtminQ6P9S1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AtminQ6P9S1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AtminQ6P9S1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AtminQ6P9S1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AtminQ6P9S1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AtminQ6P9S1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AtminQ6P9S1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AtminQ6P9S1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AtminQ6P9S1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AtminQ6P9S1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AtminQ6P9S1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AtminQ6P9S1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AtminQ6P9S1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AtminQ6P9S1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AtminQ6P9S1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AtminQ6P9S1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AtminQ6P9S1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AtminQ6P9S1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AtminQ6P9S1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AtminQ6P9S1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AtminQ6P9S1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AtminQ6P9S1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AtminQ6P9S1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AtminQ6P9S1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AtminQ6P9S1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AtminQ6P9S1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AtminQ6P9S1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AtminQ6P9S1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AtminQ6P9S1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AtminQ6P9S1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AtminQ6P9S1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AtminQ6P9S1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AtminQ6P9S1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AtminQ6P9S1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AtminQ6P9S1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AtminQ6P9S1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AtminQ6P9S1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AtminQ6P9S1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AtminQ6P9S1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AtminQ6P9S1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AtminQ6P9S1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AtminQ6P9S1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AtminQ6P9S1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AtminQ6P9S1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AtminQ6P9S1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AtminQ6P9S1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AtminQ6P9S1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AtminQ6P9S1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AtminQ6P9S1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
AtminQ6P9S1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AtminQ6P9S1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AtminQ6P9S1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AtminQ6P9S1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AtminQ6P9S1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms