Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyp2d40Q6P8N9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyp2d40Q6P8N9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyp2d40Q6P8N9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyp2d40Q6P8N9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyp2d40Q6P8N9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyp2d40Q6P8N9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyp2d40Q6P8N9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyp2d40Q6P8N9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyp2d40Q6P8N9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cyp2d40Q6P8N9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cyp2d40Q6P8N9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cyp2d40Q6P8N9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cyp2d40Q6P8N9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cyp2d40Q6P8N9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cyp2d40Q6P8N9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cyp2d40Q6P8N9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cyp2d40Q6P8N9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cyp2d40Q6P8N9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cyp2d40Q6P8N9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cyp2d40Q6P8N9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cyp2d40Q6P8N9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cyp2d40Q6P8N9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cyp2d40Q6P8N9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cyp2d40Q6P8N9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp2d40Q6P8N9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp2d40Q6P8N9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp2d40Q6P8N9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp2d40Q6P8N9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cyp2d40Q6P8N9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cyp2d40Q6P8N9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cyp2d40Q6P8N9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cyp2d40Q6P8N9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cyp2d40Q6P8N9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cyp2d40Q6P8N9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cyp2d40Q6P8N9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyp2d40Q6P8N9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyp2d40Q6P8N9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyp2d40Q6P8N9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyp2d40Q6P8N9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cyp2d40Q6P8N9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyp2d40Q6P8N9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyp2d40Q6P8N9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyp2d40Q6P8N9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyp2d40Q6P8N9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyp2d40Q6P8N9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cyp2d40Q6P8N9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cyp2d40Q6P8N9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cyp2d40Q6P8N9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cyp2d40Q6P8N9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyp2d40Q6P8N9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyp2d40Q6P8N9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyp2d40Q6P8N9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyp2d40Q6P8N9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cyp2d40Q6P8N9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cyp2d40Q6P8N9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cyp2d40Q6P8N9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp2d40Q6P8N9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp2d40Q6P8N9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp2d40Q6P8N9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp2d40Q6P8N9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp2d40Q6P8N9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp2d40Q6P8N9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp2d40Q6P8N9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp2d40Q6P8N9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp2d40Q6P8N9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp2d40Q6P8N9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cyp2d40Q6P8N9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cyp2d40Q6P8N9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cyp2d40Q6P8N9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cyp2d40Q6P8N9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cyp2d40Q6P8N9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cyp2d40Q6P8N9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cyp2d40Q6P8N9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cyp2d40Q6P8N9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cyp2d40Q6P8N9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cyp2d40Q6P8N9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cyp2d40Q6P8N9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cyp2d40Q6P8N9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cyp2d40Q6P8N9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cyp2d40Q6P8N9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cyp2d40Q6P8N9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cyp2d40Q6P8N9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cyp2d40Q6P8N9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cyp2d40Q6P8N9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cyp2d40Q6P8N9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cyp2d40Q6P8N9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cyp2d40Q6P8N9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cyp2d40Q6P8N9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cyp2d40Q6P8N9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cyp2d40Q6P8N9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cyp2d40Q6P8N9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cyp2d40Q6P8N9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cyp2d40Q6P8N9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cyp2d40Q6P8N9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp2d40Q6P8N9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp2d40Q6P8N9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp2d40Q6P8N9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms