Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXZ1

Krba1, Protein KRBA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krba1Q6NXZ1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krba1Q6NXZ1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krba1Q6NXZ1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krba1Q6NXZ1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krba1Q6NXZ1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krba1Q6NXZ1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krba1Q6NXZ1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krba1Q6NXZ1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krba1Q6NXZ1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krba1Q6NXZ1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krba1Q6NXZ1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Krba1Q6NXZ1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Krba1Q6NXZ1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krba1Q6NXZ1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krba1Q6NXZ1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krba1Q6NXZ1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krba1Q6NXZ1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krba1Q6NXZ1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krba1Q6NXZ1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krba1Q6NXZ1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krba1Q6NXZ1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krba1Q6NXZ1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Krba1Q6NXZ1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krba1Q6NXZ1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krba1Q6NXZ1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krba1Q6NXZ1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krba1Q6NXZ1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krba1Q6NXZ1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krba1Q6NXZ1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krba1Q6NXZ1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krba1Q6NXZ1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krba1Q6NXZ1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krba1Q6NXZ1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krba1Q6NXZ1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krba1Q6NXZ1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Krba1Q6NXZ1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krba1Q6NXZ1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krba1Q6NXZ1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krba1Q6NXZ1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Krba1Q6NXZ1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krba1Q6NXZ1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krba1Q6NXZ1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krba1Q6NXZ1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krba1Q6NXZ1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krba1Q6NXZ1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krba1Q6NXZ1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krba1Q6NXZ1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krba1Q6NXZ1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krba1Q6NXZ1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krba1Q6NXZ1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krba1Q6NXZ1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krba1Q6NXZ1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krba1Q6NXZ1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krba1Q6NXZ1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krba1Q6NXZ1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krba1Q6NXZ1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krba1Q6NXZ1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krba1Q6NXZ1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krba1Q6NXZ1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krba1Q6NXZ1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krba1Q6NXZ1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krba1Q6NXZ1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krba1Q6NXZ1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krba1Q6NXZ1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krba1Q6NXZ1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krba1Q6NXZ1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Krba1Q6NXZ1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krba1Q6NXZ1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krba1Q6NXZ1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krba1Q6NXZ1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krba1Q6NXZ1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krba1Q6NXZ1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krba1Q6NXZ1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krba1Q6NXZ1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krba1Q6NXZ1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krba1Q6NXZ1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krba1Q6NXZ1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krba1Q6NXZ1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krba1Q6NXZ1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krba1Q6NXZ1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krba1Q6NXZ1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krba1Q6NXZ1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krba1Q6NXZ1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krba1Q6NXZ1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krba1Q6NXZ1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krba1Q6NXZ1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krba1Q6NXZ1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Krba1Q6NXZ1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krba1Q6NXZ1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krba1Q6NXZ1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krba1Q6NXZ1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krba1Q6NXZ1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krba1Q6NXZ1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krba1Q6NXZ1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krba1Q6NXZ1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krba1Q6NXZ1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krba1Q6NXZ1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krba1Q6NXZ1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krba1Q6NXZ1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krba1Q6NXZ1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms