Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Nop58Q6DFW4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Nop58Q6DFW4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Nop58Q6DFW4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Nop58Q6DFW4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Nop58Q6DFW4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Nop58Q6DFW4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Nop58Q6DFW4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Nop58Q6DFW4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Nop58Q6DFW4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Nop58Q6DFW4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Nop58Q6DFW4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Nop58Q6DFW4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Nop58Q6DFW4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Nop58Q6DFW4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Nop58Q6DFW4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Nop58Q6DFW4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Nop58Q6DFW4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Nop58Q6DFW4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Nop58Q6DFW4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Nop58Q6DFW4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Nop58Q6DFW4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Nop58Q6DFW4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Nop58Q6DFW4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Nop58Q6DFW4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Nop58Q6DFW4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Nop58Q6DFW4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Nop58Q6DFW4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Nop58Q6DFW4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Nop58Q6DFW4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Nop58Q6DFW4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Nop58Q6DFW4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Nop58Q6DFW4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Nop58Q6DFW4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Nop58Q6DFW4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Nop58Q6DFW4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Nop58Q6DFW4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Nop58Q6DFW4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Nop58Q6DFW4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Nop58Q6DFW4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Nop58Q6DFW4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Nop58Q6DFW4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Nop58Q6DFW4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Nop58Q6DFW4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Nop58Q6DFW4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Nop58Q6DFW4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Nop58Q6DFW4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Nop58Q6DFW4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Nop58Q6DFW4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Nop58Q6DFW4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Nop58Q6DFW4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Nop58Q6DFW4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Nop58Q6DFW4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Nop58Q6DFW4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Nop58Q6DFW4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Nop58Q6DFW4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Nop58Q6DFW4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Nop58Q6DFW4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Nop58Q6DFW4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Nop58Q6DFW4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Nop58Q6DFW4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Nop58Q6DFW4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Nop58Q6DFW4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Nop58Q6DFW4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Nop58Q6DFW4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Nop58Q6DFW4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Nop58Q6DFW4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Nop58Q6DFW4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Nop58Q6DFW4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Nop58Q6DFW4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Nop58Q6DFW4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Nop58Q6DFW4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Nop58Q6DFW4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Nop58Q6DFW4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Nop58Q6DFW4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Nop58Q6DFW4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Nop58Q6DFW4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Nop58Q6DFW4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Nop58Q6DFW4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Nop58Q6DFW4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Nop58Q6DFW4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Nop58Q6DFW4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Nop58Q6DFW4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Nop58Q6DFW4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Nop58Q6DFW4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Nop58Q6DFW4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Nop58Q6DFW4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Nop58Q6DFW4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Nop58Q6DFW4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Nop58Q6DFW4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Nop58Q6DFW4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Nop58Q6DFW4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Nop58Q6DFW4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Nop58Q6DFW4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Nop58Q6DFW4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Nop58Q6DFW4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Nop58Q6DFW4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Nop58Q6DFW4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Nop58Q6DFW4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Nop58Q6DFW4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 209 ms