Protein–RNA interactions for Protein: Q6A028

Swap70, Switch-associated protein 70, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swap70Q6A028 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Swap70Q6A028 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Swap70Q6A028 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Swap70Q6A028 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Swap70Q6A028 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Swap70Q6A028 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Swap70Q6A028 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Swap70Q6A028 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Swap70Q6A028 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Swap70Q6A028 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Swap70Q6A028 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Swap70Q6A028 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Swap70Q6A028 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Swap70Q6A028 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Swap70Q6A028 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Swap70Q6A028 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Swap70Q6A028 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Swap70Q6A028 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Swap70Q6A028 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Swap70Q6A028 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Swap70Q6A028 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Swap70Q6A028 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Swap70Q6A028 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Swap70Q6A028 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Swap70Q6A028 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Swap70Q6A028 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Swap70Q6A028 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Swap70Q6A028 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Swap70Q6A028 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Swap70Q6A028 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Swap70Q6A028 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Swap70Q6A028 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Swap70Q6A028 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Swap70Q6A028 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Swap70Q6A028 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Swap70Q6A028 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Swap70Q6A028 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Swap70Q6A028 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Swap70Q6A028 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Swap70Q6A028 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Swap70Q6A028 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Swap70Q6A028 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Swap70Q6A028 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Swap70Q6A028 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Swap70Q6A028 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Swap70Q6A028 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Swap70Q6A028 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Swap70Q6A028 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Swap70Q6A028 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Swap70Q6A028 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Swap70Q6A028 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Swap70Q6A028 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Swap70Q6A028 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Swap70Q6A028 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Swap70Q6A028 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Swap70Q6A028 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Swap70Q6A028 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Swap70Q6A028 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Swap70Q6A028 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Swap70Q6A028 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Swap70Q6A028 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Swap70Q6A028 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Swap70Q6A028 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Swap70Q6A028 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Swap70Q6A028 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Swap70Q6A028 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Swap70Q6A028 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Swap70Q6A028 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Swap70Q6A028 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Swap70Q6A028 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Swap70Q6A028 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Swap70Q6A028 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Swap70Q6A028 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Swap70Q6A028 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Swap70Q6A028 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Swap70Q6A028 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Swap70Q6A028 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Swap70Q6A028 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Swap70Q6A028 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Swap70Q6A028 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Swap70Q6A028 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Swap70Q6A028 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Swap70Q6A028 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Swap70Q6A028 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Swap70Q6A028 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Swap70Q6A028 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Swap70Q6A028 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Swap70Q6A028 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Swap70Q6A028 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Swap70Q6A028 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Swap70Q6A028 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Swap70Q6A028 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Swap70Q6A028 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Swap70Q6A028 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Swap70Q6A028 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Swap70Q6A028 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Swap70Q6A028 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Swap70Q6A028 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Swap70Q6A028 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Swap70Q6A028 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms