Protein–RNA interactions for Protein: Q61286

Tcf12, Transcription factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf12Q61286 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcf12Q61286 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcf12Q61286 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcf12Q61286 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tcf12Q61286 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tcf12Q61286 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tcf12Q61286 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tcf12Q61286 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tcf12Q61286 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcf12Q61286 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcf12Q61286 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcf12Q61286 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcf12Q61286 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcf12Q61286 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcf12Q61286 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcf12Q61286 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcf12Q61286 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcf12Q61286 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcf12Q61286 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcf12Q61286 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcf12Q61286 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcf12Q61286 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcf12Q61286 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcf12Q61286 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcf12Q61286 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcf12Q61286 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcf12Q61286 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcf12Q61286 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcf12Q61286 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcf12Q61286 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcf12Q61286 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcf12Q61286 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcf12Q61286 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcf12Q61286 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcf12Q61286 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcf12Q61286 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tcf12Q61286 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tcf12Q61286 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tcf12Q61286 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tcf12Q61286 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tcf12Q61286 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tcf12Q61286 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tcf12Q61286 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tcf12Q61286 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tcf12Q61286 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcf12Q61286 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcf12Q61286 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcf12Q61286 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcf12Q61286 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tcf12Q61286 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tcf12Q61286 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tcf12Q61286 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tcf12Q61286 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tcf12Q61286 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tcf12Q61286 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tcf12Q61286 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tcf12Q61286 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tcf12Q61286 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tcf12Q61286 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tcf12Q61286 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tcf12Q61286 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcf12Q61286 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcf12Q61286 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcf12Q61286 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcf12Q61286 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcf12Q61286 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcf12Q61286 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcf12Q61286 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcf12Q61286 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcf12Q61286 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tcf12Q61286 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tcf12Q61286 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tcf12Q61286 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tcf12Q61286 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tcf12Q61286 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tcf12Q61286 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tcf12Q61286 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tcf12Q61286 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tcf12Q61286 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tcf12Q61286 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tcf12Q61286 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tcf12Q61286 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcf12Q61286 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcf12Q61286 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcf12Q61286 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcf12Q61286 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcf12Q61286 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcf12Q61286 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tcf12Q61286 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tcf12Q61286 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tcf12Q61286 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tcf12Q61286 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcf12Q61286 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcf12Q61286 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcf12Q61286 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcf12Q61286 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcf12Q61286 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcf12Q61286 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcf12Q61286 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcf12Q61286 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms