Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klf4Q60793 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klf4Q60793 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klf4Q60793 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klf4Q60793 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klf4Q60793 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klf4Q60793 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klf4Q60793 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klf4Q60793 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klf4Q60793 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klf4Q60793 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klf4Q60793 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klf4Q60793 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klf4Q60793 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klf4Q60793 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klf4Q60793 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klf4Q60793 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klf4Q60793 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klf4Q60793 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Klf4Q60793 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klf4Q60793 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klf4Q60793 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klf4Q60793 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klf4Q60793 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klf4Q60793 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klf4Q60793 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klf4Q60793 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klf4Q60793 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klf4Q60793 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klf4Q60793 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klf4Q60793 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klf4Q60793 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klf4Q60793 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klf4Q60793 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klf4Q60793 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klf4Q60793 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klf4Q60793 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Klf4Q60793 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klf4Q60793 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klf4Q60793 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klf4Q60793 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klf4Q60793 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klf4Q60793 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klf4Q60793 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Klf4Q60793 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klf4Q60793 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Klf4Q60793 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klf4Q60793 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klf4Q60793 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klf4Q60793 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klf4Q60793 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klf4Q60793 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klf4Q60793 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klf4Q60793 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Klf4Q60793 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klf4Q60793 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klf4Q60793 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Klf4Q60793 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klf4Q60793 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klf4Q60793 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klf4Q60793 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klf4Q60793 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klf4Q60793 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klf4Q60793 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klf4Q60793 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klf4Q60793 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klf4Q60793 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Klf4Q60793 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klf4Q60793 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klf4Q60793 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klf4Q60793 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klf4Q60793 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klf4Q60793 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klf4Q60793 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klf4Q60793 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klf4Q60793 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klf4Q60793 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klf4Q60793 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klf4Q60793 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klf4Q60793 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klf4Q60793 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klf4Q60793 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klf4Q60793 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klf4Q60793 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klf4Q60793 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klf4Q60793 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klf4Q60793 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klf4Q60793 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klf4Q60793 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klf4Q60793 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Klf4Q60793 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klf4Q60793 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klf4Q60793 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klf4Q60793 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Klf4Q60793 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klf4Q60793 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Klf4Q60793 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Klf4Q60793 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Klf4Q60793 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klf4Q60793 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms