Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SkiQ60698 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SkiQ60698 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SkiQ60698 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SkiQ60698 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SkiQ60698 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SkiQ60698 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SkiQ60698 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SkiQ60698 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SkiQ60698 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SkiQ60698 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SkiQ60698 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SkiQ60698 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SkiQ60698 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SkiQ60698 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SkiQ60698 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SkiQ60698 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SkiQ60698 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SkiQ60698 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SkiQ60698 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SkiQ60698 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SkiQ60698 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SkiQ60698 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SkiQ60698 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SkiQ60698 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SkiQ60698 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SkiQ60698 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SkiQ60698 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SkiQ60698 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SkiQ60698 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SkiQ60698 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SkiQ60698 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SkiQ60698 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SkiQ60698 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SkiQ60698 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SkiQ60698 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SkiQ60698 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SkiQ60698 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SkiQ60698 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SkiQ60698 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SkiQ60698 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SkiQ60698 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SkiQ60698 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SkiQ60698 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SkiQ60698 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SkiQ60698 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SkiQ60698 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SkiQ60698 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SkiQ60698 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SkiQ60698 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SkiQ60698 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SkiQ60698 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SkiQ60698 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SkiQ60698 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SkiQ60698 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SkiQ60698 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SkiQ60698 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SkiQ60698 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SkiQ60698 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SkiQ60698 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SkiQ60698 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SkiQ60698 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SkiQ60698 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SkiQ60698 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SkiQ60698 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SkiQ60698 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SkiQ60698 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SkiQ60698 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SkiQ60698 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SkiQ60698 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SkiQ60698 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SkiQ60698 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SkiQ60698 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SkiQ60698 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SkiQ60698 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SkiQ60698 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SkiQ60698 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SkiQ60698 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SkiQ60698 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SkiQ60698 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SkiQ60698 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SkiQ60698 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SkiQ60698 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SkiQ60698 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SkiQ60698 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SkiQ60698 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SkiQ60698 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SkiQ60698 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SkiQ60698 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SkiQ60698 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SkiQ60698 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SkiQ60698 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SkiQ60698 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SkiQ60698 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SkiQ60698 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SkiQ60698 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SkiQ60698 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SkiQ60698 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SkiQ60698 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SkiQ60698 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms