Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJY5

Arcn1, Coatomer subunit delta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arcn1Q5XJY5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arcn1Q5XJY5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arcn1Q5XJY5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Arcn1Q5XJY5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Arcn1Q5XJY5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Arcn1Q5XJY5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Arcn1Q5XJY5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arcn1Q5XJY5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arcn1Q5XJY5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arcn1Q5XJY5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arcn1Q5XJY5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arcn1Q5XJY5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Arcn1Q5XJY5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arcn1Q5XJY5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arcn1Q5XJY5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arcn1Q5XJY5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arcn1Q5XJY5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arcn1Q5XJY5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arcn1Q5XJY5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arcn1Q5XJY5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arcn1Q5XJY5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arcn1Q5XJY5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arcn1Q5XJY5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Arcn1Q5XJY5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arcn1Q5XJY5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arcn1Q5XJY5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arcn1Q5XJY5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arcn1Q5XJY5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arcn1Q5XJY5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arcn1Q5XJY5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arcn1Q5XJY5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arcn1Q5XJY5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arcn1Q5XJY5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arcn1Q5XJY5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arcn1Q5XJY5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arcn1Q5XJY5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arcn1Q5XJY5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arcn1Q5XJY5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arcn1Q5XJY5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arcn1Q5XJY5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arcn1Q5XJY5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arcn1Q5XJY5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arcn1Q5XJY5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arcn1Q5XJY5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arcn1Q5XJY5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arcn1Q5XJY5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arcn1Q5XJY5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arcn1Q5XJY5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arcn1Q5XJY5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arcn1Q5XJY5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Arcn1Q5XJY5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arcn1Q5XJY5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Arcn1Q5XJY5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arcn1Q5XJY5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arcn1Q5XJY5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arcn1Q5XJY5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arcn1Q5XJY5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arcn1Q5XJY5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arcn1Q5XJY5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arcn1Q5XJY5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arcn1Q5XJY5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arcn1Q5XJY5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arcn1Q5XJY5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arcn1Q5XJY5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arcn1Q5XJY5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arcn1Q5XJY5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arcn1Q5XJY5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arcn1Q5XJY5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arcn1Q5XJY5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arcn1Q5XJY5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arcn1Q5XJY5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arcn1Q5XJY5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arcn1Q5XJY5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arcn1Q5XJY5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arcn1Q5XJY5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arcn1Q5XJY5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arcn1Q5XJY5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arcn1Q5XJY5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Arcn1Q5XJY5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arcn1Q5XJY5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arcn1Q5XJY5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arcn1Q5XJY5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arcn1Q5XJY5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arcn1Q5XJY5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Arcn1Q5XJY5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Arcn1Q5XJY5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Arcn1Q5XJY5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Arcn1Q5XJY5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Arcn1Q5XJY5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Arcn1Q5XJY5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arcn1Q5XJY5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arcn1Q5XJY5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arcn1Q5XJY5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arcn1Q5XJY5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arcn1Q5XJY5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Arcn1Q5XJY5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arcn1Q5XJY5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arcn1Q5XJY5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arcn1Q5XJY5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arcn1Q5XJY5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms