Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Specc1Q5SXY1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Specc1Q5SXY1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Specc1Q5SXY1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Specc1Q5SXY1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Specc1Q5SXY1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Specc1Q5SXY1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Specc1Q5SXY1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Specc1Q5SXY1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Specc1Q5SXY1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Specc1Q5SXY1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Specc1Q5SXY1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Specc1Q5SXY1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Specc1Q5SXY1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Specc1Q5SXY1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Specc1Q5SXY1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Specc1Q5SXY1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Specc1Q5SXY1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Specc1Q5SXY1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Specc1Q5SXY1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Specc1Q5SXY1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Specc1Q5SXY1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Specc1Q5SXY1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Specc1Q5SXY1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Specc1Q5SXY1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Specc1Q5SXY1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Specc1Q5SXY1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Specc1Q5SXY1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Specc1Q5SXY1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Specc1Q5SXY1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Specc1Q5SXY1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Specc1Q5SXY1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Specc1Q5SXY1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Specc1Q5SXY1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Specc1Q5SXY1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Specc1Q5SXY1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Specc1Q5SXY1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Specc1Q5SXY1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Specc1Q5SXY1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Specc1Q5SXY1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Specc1Q5SXY1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Specc1Q5SXY1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Specc1Q5SXY1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Specc1Q5SXY1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Specc1Q5SXY1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Specc1Q5SXY1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Specc1Q5SXY1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Specc1Q5SXY1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Specc1Q5SXY1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Specc1Q5SXY1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Specc1Q5SXY1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Specc1Q5SXY1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Specc1Q5SXY1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Specc1Q5SXY1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Specc1Q5SXY1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Specc1Q5SXY1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Specc1Q5SXY1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Specc1Q5SXY1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Specc1Q5SXY1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Specc1Q5SXY1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Specc1Q5SXY1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Specc1Q5SXY1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Specc1Q5SXY1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Specc1Q5SXY1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Specc1Q5SXY1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Specc1Q5SXY1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Specc1Q5SXY1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Specc1Q5SXY1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Specc1Q5SXY1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Specc1Q5SXY1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Specc1Q5SXY1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Specc1Q5SXY1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Specc1Q5SXY1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Specc1Q5SXY1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Specc1Q5SXY1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Specc1Q5SXY1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Specc1Q5SXY1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Specc1Q5SXY1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Specc1Q5SXY1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Specc1Q5SXY1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Specc1Q5SXY1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Specc1Q5SXY1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Specc1Q5SXY1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Specc1Q5SXY1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Specc1Q5SXY1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Specc1Q5SXY1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Specc1Q5SXY1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Specc1Q5SXY1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Specc1Q5SXY1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Specc1Q5SXY1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Specc1Q5SXY1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Specc1Q5SXY1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Specc1Q5SXY1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Specc1Q5SXY1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Specc1Q5SXY1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Specc1Q5SXY1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Specc1Q5SXY1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Specc1Q5SXY1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Specc1Q5SXY1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Specc1Q5SXY1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms