Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
9930111J21Rik1Q5SVP0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
9930111J21Rik1Q5SVP0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
9930111J21Rik1Q5SVP0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
9930111J21Rik1Q5SVP0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
9930111J21Rik1Q5SVP0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
9930111J21Rik1Q5SVP0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
9930111J21Rik1Q5SVP0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
9930111J21Rik1Q5SVP0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.29■■□□□ 1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
9930111J21Rik1Q5SVP0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.27■■□□□ 1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
9930111J21Rik1Q5SVP0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
9930111J21Rik1Q5SVP0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
9930111J21Rik1Q5SVP0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
9930111J21Rik1Q5SVP0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
9930111J21Rik1Q5SVP0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
9930111J21Rik1Q5SVP0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms