Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC57

Fam183b, Protein FAM183B, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam183bQ5NC57 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam183bQ5NC57 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam183bQ5NC57 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam183bQ5NC57 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam183bQ5NC57 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam183bQ5NC57 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam183bQ5NC57 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fam183bQ5NC57 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam183bQ5NC57 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam183bQ5NC57 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam183bQ5NC57 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam183bQ5NC57 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam183bQ5NC57 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam183bQ5NC57 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam183bQ5NC57 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam183bQ5NC57 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam183bQ5NC57 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam183bQ5NC57 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam183bQ5NC57 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam183bQ5NC57 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam183bQ5NC57 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam183bQ5NC57 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam183bQ5NC57 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam183bQ5NC57 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam183bQ5NC57 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam183bQ5NC57 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam183bQ5NC57 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam183bQ5NC57 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam183bQ5NC57 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam183bQ5NC57 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam183bQ5NC57 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam183bQ5NC57 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam183bQ5NC57 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam183bQ5NC57 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam183bQ5NC57 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam183bQ5NC57 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Fam183bQ5NC57 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam183bQ5NC57 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam183bQ5NC57 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam183bQ5NC57 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam183bQ5NC57 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam183bQ5NC57 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam183bQ5NC57 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam183bQ5NC57 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam183bQ5NC57 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam183bQ5NC57 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam183bQ5NC57 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam183bQ5NC57 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam183bQ5NC57 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam183bQ5NC57 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam183bQ5NC57 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam183bQ5NC57 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam183bQ5NC57 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam183bQ5NC57 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam183bQ5NC57 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam183bQ5NC57 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam183bQ5NC57 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam183bQ5NC57 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam183bQ5NC57 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam183bQ5NC57 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam183bQ5NC57 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam183bQ5NC57 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam183bQ5NC57 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam183bQ5NC57 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam183bQ5NC57 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam183bQ5NC57 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam183bQ5NC57 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam183bQ5NC57 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam183bQ5NC57 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam183bQ5NC57 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam183bQ5NC57 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam183bQ5NC57 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam183bQ5NC57 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam183bQ5NC57 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam183bQ5NC57 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam183bQ5NC57 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Fam183bQ5NC57 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Fam183bQ5NC57 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam183bQ5NC57 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam183bQ5NC57 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam183bQ5NC57 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam183bQ5NC57 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam183bQ5NC57 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam183bQ5NC57 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam183bQ5NC57 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam183bQ5NC57 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam183bQ5NC57 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam183bQ5NC57 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam183bQ5NC57 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam183bQ5NC57 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam183bQ5NC57 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam183bQ5NC57 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam183bQ5NC57 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam183bQ5NC57 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam183bQ5NC57 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam183bQ5NC57 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam183bQ5NC57 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam183bQ5NC57 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam183bQ5NC57 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam183bQ5NC57 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms