Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccnl1Q52KE7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccnl1Q52KE7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccnl1Q52KE7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccnl1Q52KE7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccnl1Q52KE7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccnl1Q52KE7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccnl1Q52KE7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccnl1Q52KE7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccnl1Q52KE7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccnl1Q52KE7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccnl1Q52KE7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccnl1Q52KE7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccnl1Q52KE7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccnl1Q52KE7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccnl1Q52KE7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccnl1Q52KE7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccnl1Q52KE7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccnl1Q52KE7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ccnl1Q52KE7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccnl1Q52KE7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccnl1Q52KE7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccnl1Q52KE7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccnl1Q52KE7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccnl1Q52KE7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccnl1Q52KE7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccnl1Q52KE7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccnl1Q52KE7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccnl1Q52KE7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccnl1Q52KE7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccnl1Q52KE7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccnl1Q52KE7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccnl1Q52KE7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccnl1Q52KE7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccnl1Q52KE7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccnl1Q52KE7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccnl1Q52KE7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccnl1Q52KE7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccnl1Q52KE7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccnl1Q52KE7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccnl1Q52KE7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccnl1Q52KE7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccnl1Q52KE7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccnl1Q52KE7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccnl1Q52KE7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccnl1Q52KE7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccnl1Q52KE7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccnl1Q52KE7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Ccnl1Q52KE7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccnl1Q52KE7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccnl1Q52KE7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccnl1Q52KE7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccnl1Q52KE7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccnl1Q52KE7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccnl1Q52KE7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccnl1Q52KE7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccnl1Q52KE7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccnl1Q52KE7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccnl1Q52KE7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccnl1Q52KE7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccnl1Q52KE7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccnl1Q52KE7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccnl1Q52KE7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccnl1Q52KE7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccnl1Q52KE7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccnl1Q52KE7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccnl1Q52KE7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccnl1Q52KE7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccnl1Q52KE7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccnl1Q52KE7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccnl1Q52KE7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccnl1Q52KE7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccnl1Q52KE7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccnl1Q52KE7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccnl1Q52KE7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccnl1Q52KE7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccnl1Q52KE7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccnl1Q52KE7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccnl1Q52KE7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccnl1Q52KE7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccnl1Q52KE7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccnl1Q52KE7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccnl1Q52KE7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccnl1Q52KE7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccnl1Q52KE7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccnl1Q52KE7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccnl1Q52KE7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccnl1Q52KE7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccnl1Q52KE7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccnl1Q52KE7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccnl1Q52KE7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccnl1Q52KE7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccnl1Q52KE7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccnl1Q52KE7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccnl1Q52KE7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccnl1Q52KE7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccnl1Q52KE7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccnl1Q52KE7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccnl1Q52KE7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccnl1Q52KE7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms