Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1V3

Esf1, ESF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esf1Q3V1V3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Esf1Q3V1V3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Esf1Q3V1V3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Esf1Q3V1V3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Esf1Q3V1V3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Esf1Q3V1V3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Esf1Q3V1V3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Esf1Q3V1V3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Esf1Q3V1V3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Esf1Q3V1V3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Esf1Q3V1V3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Esf1Q3V1V3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
Esf1Q3V1V3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
Esf1Q3V1V3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Esf1Q3V1V3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Esf1Q3V1V3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Esf1Q3V1V3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Esf1Q3V1V3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Esf1Q3V1V3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Esf1Q3V1V3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Esf1Q3V1V3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Esf1Q3V1V3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Esf1Q3V1V3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
Esf1Q3V1V3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
Esf1Q3V1V3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Esf1Q3V1V3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
Esf1Q3V1V3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Esf1Q3V1V3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Esf1Q3V1V3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Esf1Q3V1V3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Esf1Q3V1V3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Esf1Q3V1V3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Esf1Q3V1V3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
Esf1Q3V1V3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Esf1Q3V1V3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Esf1Q3V1V3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Esf1Q3V1V3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Esf1Q3V1V3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Esf1Q3V1V3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Esf1Q3V1V3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Esf1Q3V1V3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Esf1Q3V1V3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Esf1Q3V1V3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Esf1Q3V1V3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Esf1Q3V1V3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Esf1Q3V1V3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Esf1Q3V1V3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Esf1Q3V1V3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Esf1Q3V1V3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Esf1Q3V1V3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Esf1Q3V1V3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Esf1Q3V1V3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Esf1Q3V1V3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Esf1Q3V1V3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Esf1Q3V1V3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Esf1Q3V1V3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Esf1Q3V1V3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Esf1Q3V1V3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Esf1Q3V1V3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Esf1Q3V1V3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Esf1Q3V1V3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC38.13■■■■□ 3.69
Esf1Q3V1V3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Esf1Q3V1V3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Esf1Q3V1V3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Esf1Q3V1V3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Esf1Q3V1V3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Esf1Q3V1V3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
Esf1Q3V1V3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Esf1Q3V1V3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Esf1Q3V1V3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Esf1Q3V1V3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Esf1Q3V1V3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
Esf1Q3V1V3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Esf1Q3V1V3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Esf1Q3V1V3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Esf1Q3V1V3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Esf1Q3V1V3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Esf1Q3V1V3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Esf1Q3V1V3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Esf1Q3V1V3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Esf1Q3V1V3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Esf1Q3V1V3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Esf1Q3V1V3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
Esf1Q3V1V3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Esf1Q3V1V3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Esf1Q3V1V3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Esf1Q3V1V3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Esf1Q3V1V3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Esf1Q3V1V3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
Esf1Q3V1V3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Esf1Q3V1V3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Esf1Q3V1V3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Esf1Q3V1V3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Esf1Q3V1V3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Esf1Q3V1V3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Esf1Q3V1V3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Esf1Q3V1V3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Esf1Q3V1V3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
Esf1Q3V1V3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
Esf1Q3V1V3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms