Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm28047Q3US59 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm28047Q3US59 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm28047Q3US59 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm28047Q3US59 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm28047Q3US59 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm28047Q3US59 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm28047Q3US59 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm28047Q3US59 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm28047Q3US59 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm28047Q3US59 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm28047Q3US59 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm28047Q3US59 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm28047Q3US59 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm28047Q3US59 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm28047Q3US59 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm28047Q3US59 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm28047Q3US59 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm28047Q3US59 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm28047Q3US59 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm28047Q3US59 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm28047Q3US59 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm28047Q3US59 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm28047Q3US59 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm28047Q3US59 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm28047Q3US59 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gm28047Q3US59 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm28047Q3US59 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm28047Q3US59 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm28047Q3US59 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm28047Q3US59 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm28047Q3US59 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm28047Q3US59 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm28047Q3US59 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm28047Q3US59 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm28047Q3US59 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm28047Q3US59 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm28047Q3US59 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm28047Q3US59 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm28047Q3US59 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm28047Q3US59 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm28047Q3US59 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm28047Q3US59 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm28047Q3US59 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm28047Q3US59 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm28047Q3US59 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm28047Q3US59 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm28047Q3US59 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm28047Q3US59 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm28047Q3US59 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm28047Q3US59 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm28047Q3US59 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm28047Q3US59 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm28047Q3US59 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm28047Q3US59 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm28047Q3US59 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gm28047Q3US59 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gm28047Q3US59 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gm28047Q3US59 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gm28047Q3US59 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm28047Q3US59 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm28047Q3US59 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm28047Q3US59 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm28047Q3US59 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm28047Q3US59 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm28047Q3US59 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm28047Q3US59 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm28047Q3US59 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm28047Q3US59 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm28047Q3US59 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm28047Q3US59 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm28047Q3US59 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm28047Q3US59 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm28047Q3US59 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm28047Q3US59 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm28047Q3US59 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm28047Q3US59 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm28047Q3US59 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm28047Q3US59 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm28047Q3US59 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm28047Q3US59 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm28047Q3US59 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm28047Q3US59 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm28047Q3US59 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm28047Q3US59 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm28047Q3US59 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm28047Q3US59 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm28047Q3US59 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm28047Q3US59 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm28047Q3US59 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm28047Q3US59 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm28047Q3US59 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm28047Q3US59 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm28047Q3US59 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm28047Q3US59 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm28047Q3US59 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm28047Q3US59 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm28047Q3US59 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm28047Q3US59 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm28047Q3US59 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms