Protein–RNA interactions for Protein: Q3URQ4

Fam8a1, Family with sequence similarity 8, member A1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam8a1Q3URQ4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam8a1Q3URQ4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam8a1Q3URQ4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam8a1Q3URQ4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam8a1Q3URQ4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam8a1Q3URQ4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam8a1Q3URQ4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam8a1Q3URQ4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam8a1Q3URQ4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam8a1Q3URQ4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam8a1Q3URQ4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam8a1Q3URQ4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam8a1Q3URQ4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam8a1Q3URQ4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam8a1Q3URQ4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam8a1Q3URQ4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam8a1Q3URQ4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam8a1Q3URQ4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam8a1Q3URQ4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam8a1Q3URQ4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam8a1Q3URQ4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam8a1Q3URQ4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam8a1Q3URQ4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam8a1Q3URQ4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam8a1Q3URQ4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam8a1Q3URQ4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam8a1Q3URQ4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam8a1Q3URQ4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam8a1Q3URQ4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam8a1Q3URQ4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam8a1Q3URQ4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam8a1Q3URQ4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam8a1Q3URQ4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam8a1Q3URQ4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam8a1Q3URQ4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam8a1Q3URQ4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam8a1Q3URQ4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam8a1Q3URQ4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam8a1Q3URQ4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam8a1Q3URQ4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam8a1Q3URQ4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam8a1Q3URQ4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam8a1Q3URQ4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam8a1Q3URQ4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam8a1Q3URQ4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam8a1Q3URQ4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam8a1Q3URQ4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam8a1Q3URQ4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam8a1Q3URQ4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam8a1Q3URQ4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam8a1Q3URQ4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam8a1Q3URQ4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam8a1Q3URQ4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam8a1Q3URQ4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam8a1Q3URQ4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fam8a1Q3URQ4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam8a1Q3URQ4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam8a1Q3URQ4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam8a1Q3URQ4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam8a1Q3URQ4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam8a1Q3URQ4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam8a1Q3URQ4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam8a1Q3URQ4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam8a1Q3URQ4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam8a1Q3URQ4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam8a1Q3URQ4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam8a1Q3URQ4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam8a1Q3URQ4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam8a1Q3URQ4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam8a1Q3URQ4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam8a1Q3URQ4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam8a1Q3URQ4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam8a1Q3URQ4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam8a1Q3URQ4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam8a1Q3URQ4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam8a1Q3URQ4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam8a1Q3URQ4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam8a1Q3URQ4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam8a1Q3URQ4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam8a1Q3URQ4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam8a1Q3URQ4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam8a1Q3URQ4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam8a1Q3URQ4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam8a1Q3URQ4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Fam8a1Q3URQ4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam8a1Q3URQ4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam8a1Q3URQ4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam8a1Q3URQ4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam8a1Q3URQ4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam8a1Q3URQ4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam8a1Q3URQ4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam8a1Q3URQ4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam8a1Q3URQ4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam8a1Q3URQ4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam8a1Q3URQ4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam8a1Q3URQ4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam8a1Q3URQ4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam8a1Q3URQ4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam8a1Q3URQ4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam8a1Q3URQ4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms