Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR97

Snx21, Sorting nexin-21, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx21Q3UR97 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx21Q3UR97 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx21Q3UR97 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx21Q3UR97 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx21Q3UR97 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx21Q3UR97 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx21Q3UR97 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx21Q3UR97 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx21Q3UR97 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx21Q3UR97 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx21Q3UR97 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx21Q3UR97 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx21Q3UR97 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx21Q3UR97 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx21Q3UR97 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx21Q3UR97 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx21Q3UR97 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx21Q3UR97 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx21Q3UR97 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx21Q3UR97 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx21Q3UR97 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx21Q3UR97 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx21Q3UR97 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx21Q3UR97 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Snx21Q3UR97 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx21Q3UR97 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx21Q3UR97 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx21Q3UR97 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Snx21Q3UR97 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Snx21Q3UR97 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Snx21Q3UR97 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Snx21Q3UR97 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx21Q3UR97 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx21Q3UR97 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx21Q3UR97 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx21Q3UR97 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx21Q3UR97 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx21Q3UR97 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx21Q3UR97 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx21Q3UR97 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx21Q3UR97 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx21Q3UR97 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx21Q3UR97 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx21Q3UR97 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx21Q3UR97 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx21Q3UR97 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx21Q3UR97 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx21Q3UR97 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx21Q3UR97 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx21Q3UR97 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx21Q3UR97 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx21Q3UR97 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx21Q3UR97 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx21Q3UR97 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx21Q3UR97 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx21Q3UR97 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx21Q3UR97 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms