Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cln5Q3UMW8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cln5Q3UMW8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cln5Q3UMW8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cln5Q3UMW8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cln5Q3UMW8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cln5Q3UMW8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cln5Q3UMW8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cln5Q3UMW8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cln5Q3UMW8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cln5Q3UMW8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cln5Q3UMW8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cln5Q3UMW8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cln5Q3UMW8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cln5Q3UMW8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cln5Q3UMW8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cln5Q3UMW8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cln5Q3UMW8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cln5Q3UMW8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cln5Q3UMW8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cln5Q3UMW8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cln5Q3UMW8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cln5Q3UMW8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cln5Q3UMW8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cln5Q3UMW8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cln5Q3UMW8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cln5Q3UMW8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cln5Q3UMW8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cln5Q3UMW8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cln5Q3UMW8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cln5Q3UMW8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cln5Q3UMW8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cln5Q3UMW8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cln5Q3UMW8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cln5Q3UMW8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cln5Q3UMW8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cln5Q3UMW8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cln5Q3UMW8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cln5Q3UMW8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cln5Q3UMW8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cln5Q3UMW8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cln5Q3UMW8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cln5Q3UMW8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cln5Q3UMW8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cln5Q3UMW8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cln5Q3UMW8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cln5Q3UMW8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cln5Q3UMW8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cln5Q3UMW8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cln5Q3UMW8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cln5Q3UMW8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cln5Q3UMW8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cln5Q3UMW8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cln5Q3UMW8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cln5Q3UMW8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cln5Q3UMW8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cln5Q3UMW8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cln5Q3UMW8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cln5Q3UMW8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cln5Q3UMW8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cln5Q3UMW8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cln5Q3UMW8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cln5Q3UMW8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cln5Q3UMW8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cln5Q3UMW8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cln5Q3UMW8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cln5Q3UMW8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cln5Q3UMW8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cln5Q3UMW8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cln5Q3UMW8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cln5Q3UMW8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cln5Q3UMW8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cln5Q3UMW8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cln5Q3UMW8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cln5Q3UMW8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cln5Q3UMW8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cln5Q3UMW8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cln5Q3UMW8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cln5Q3UMW8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cln5Q3UMW8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cln5Q3UMW8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cln5Q3UMW8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cln5Q3UMW8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cln5Q3UMW8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cln5Q3UMW8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cln5Q3UMW8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cln5Q3UMW8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cln5Q3UMW8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cln5Q3UMW8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms