Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Parp3Q3ULW8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Parp3Q3ULW8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Parp3Q3ULW8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Parp3Q3ULW8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Parp3Q3ULW8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Parp3Q3ULW8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Parp3Q3ULW8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Parp3Q3ULW8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Parp3Q3ULW8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Parp3Q3ULW8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Parp3Q3ULW8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Parp3Q3ULW8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Parp3Q3ULW8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Parp3Q3ULW8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Parp3Q3ULW8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Parp3Q3ULW8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Parp3Q3ULW8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Parp3Q3ULW8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Parp3Q3ULW8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Parp3Q3ULW8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Parp3Q3ULW8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Parp3Q3ULW8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Parp3Q3ULW8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Parp3Q3ULW8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Parp3Q3ULW8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Parp3Q3ULW8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Parp3Q3ULW8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Parp3Q3ULW8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Parp3Q3ULW8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Parp3Q3ULW8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Parp3Q3ULW8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Parp3Q3ULW8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Parp3Q3ULW8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Parp3Q3ULW8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Parp3Q3ULW8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Parp3Q3ULW8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Parp3Q3ULW8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Parp3Q3ULW8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Parp3Q3ULW8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Parp3Q3ULW8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Parp3Q3ULW8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Parp3Q3ULW8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Parp3Q3ULW8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Parp3Q3ULW8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Parp3Q3ULW8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Parp3Q3ULW8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Parp3Q3ULW8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Parp3Q3ULW8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Parp3Q3ULW8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Parp3Q3ULW8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Parp3Q3ULW8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Parp3Q3ULW8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Parp3Q3ULW8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Parp3Q3ULW8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Parp3Q3ULW8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Parp3Q3ULW8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Parp3Q3ULW8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Parp3Q3ULW8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Parp3Q3ULW8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Parp3Q3ULW8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Parp3Q3ULW8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Parp3Q3ULW8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Parp3Q3ULW8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Parp3Q3ULW8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Parp3Q3ULW8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Parp3Q3ULW8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Parp3Q3ULW8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Parp3Q3ULW8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Parp3Q3ULW8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Parp3Q3ULW8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Parp3Q3ULW8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Parp3Q3ULW8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Parp3Q3ULW8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Parp3Q3ULW8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Parp3Q3ULW8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Parp3Q3ULW8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Parp3Q3ULW8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Parp3Q3ULW8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Parp3Q3ULW8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Parp3Q3ULW8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Parp3Q3ULW8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Parp3Q3ULW8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Parp3Q3ULW8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Parp3Q3ULW8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Parp3Q3ULW8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Parp3Q3ULW8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Parp3Q3ULW8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Parp3Q3ULW8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Parp3Q3ULW8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Parp3Q3ULW8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Parp3Q3ULW8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Parp3Q3ULW8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Parp3Q3ULW8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Parp3Q3ULW8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Parp3Q3ULW8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Parp3Q3ULW8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Parp3Q3ULW8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Parp3Q3ULW8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Parp3Q3ULW8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms