Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdlim7Q3TJD7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdlim7Q3TJD7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdlim7Q3TJD7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdlim7Q3TJD7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdlim7Q3TJD7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdlim7Q3TJD7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdlim7Q3TJD7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdlim7Q3TJD7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdlim7Q3TJD7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdlim7Q3TJD7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdlim7Q3TJD7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdlim7Q3TJD7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdlim7Q3TJD7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdlim7Q3TJD7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdlim7Q3TJD7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdlim7Q3TJD7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdlim7Q3TJD7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdlim7Q3TJD7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdlim7Q3TJD7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdlim7Q3TJD7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdlim7Q3TJD7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdlim7Q3TJD7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdlim7Q3TJD7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdlim7Q3TJD7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdlim7Q3TJD7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdlim7Q3TJD7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdlim7Q3TJD7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdlim7Q3TJD7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdlim7Q3TJD7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pdlim7Q3TJD7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdlim7Q3TJD7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdlim7Q3TJD7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdlim7Q3TJD7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdlim7Q3TJD7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdlim7Q3TJD7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdlim7Q3TJD7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdlim7Q3TJD7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdlim7Q3TJD7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdlim7Q3TJD7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdlim7Q3TJD7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdlim7Q3TJD7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdlim7Q3TJD7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdlim7Q3TJD7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdlim7Q3TJD7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdlim7Q3TJD7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdlim7Q3TJD7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdlim7Q3TJD7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdlim7Q3TJD7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdlim7Q3TJD7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdlim7Q3TJD7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdlim7Q3TJD7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdlim7Q3TJD7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdlim7Q3TJD7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdlim7Q3TJD7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdlim7Q3TJD7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdlim7Q3TJD7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdlim7Q3TJD7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdlim7Q3TJD7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdlim7Q3TJD7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdlim7Q3TJD7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdlim7Q3TJD7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdlim7Q3TJD7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdlim7Q3TJD7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdlim7Q3TJD7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdlim7Q3TJD7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdlim7Q3TJD7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdlim7Q3TJD7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdlim7Q3TJD7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdlim7Q3TJD7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdlim7Q3TJD7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdlim7Q3TJD7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdlim7Q3TJD7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdlim7Q3TJD7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdlim7Q3TJD7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdlim7Q3TJD7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdlim7Q3TJD7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdlim7Q3TJD7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdlim7Q3TJD7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdlim7Q3TJD7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdlim7Q3TJD7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdlim7Q3TJD7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdlim7Q3TJD7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdlim7Q3TJD7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pdlim7Q3TJD7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdlim7Q3TJD7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdlim7Q3TJD7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdlim7Q3TJD7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdlim7Q3TJD7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdlim7Q3TJD7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdlim7Q3TJD7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdlim7Q3TJD7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdlim7Q3TJD7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdlim7Q3TJD7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdlim7Q3TJD7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdlim7Q3TJD7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdlim7Q3TJD7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdlim7Q3TJD7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdlim7Q3TJD7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdlim7Q3TJD7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.4 ms