Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc13Q3TIR1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc13Q3TIR1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc13Q3TIR1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc13Q3TIR1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc13Q3TIR1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc13Q3TIR1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc13Q3TIR1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc13Q3TIR1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc13Q3TIR1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc13Q3TIR1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc13Q3TIR1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc13Q3TIR1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc13Q3TIR1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc13Q3TIR1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc13Q3TIR1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc13Q3TIR1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc13Q3TIR1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc13Q3TIR1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc13Q3TIR1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc13Q3TIR1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc13Q3TIR1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc13Q3TIR1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc13Q3TIR1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc13Q3TIR1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc13Q3TIR1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc13Q3TIR1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc13Q3TIR1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc13Q3TIR1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc13Q3TIR1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc13Q3TIR1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc13Q3TIR1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc13Q3TIR1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc13Q3TIR1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc13Q3TIR1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc13Q3TIR1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc13Q3TIR1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc13Q3TIR1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc13Q3TIR1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc13Q3TIR1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc13Q3TIR1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc13Q3TIR1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc13Q3TIR1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc13Q3TIR1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc13Q3TIR1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc13Q3TIR1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc13Q3TIR1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc13Q3TIR1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc13Q3TIR1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc13Q3TIR1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc13Q3TIR1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc13Q3TIR1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc13Q3TIR1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc13Q3TIR1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc13Q3TIR1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc13Q3TIR1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc13Q3TIR1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc13Q3TIR1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms